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Enregistrement W4405035945 · doi:10.1016/j.trac.2024.118097

Marine specialized metabolites: Unveiling Nature's chemical treasures from the deep blue

2024· article· en· W4405035945 sur OpenAlexafffund
Thilina U. Jayawardena, Natacha Mérindol, Nuwan Sameera Liyanage, Fatima Awwad, Isabel Desgagné‐Penix

Notice bibliographique

RevueTrAC Trends in Analytical Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesUniversité du Québec à Trois-Rivières
Mots-clésAstrobiologyChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Marine specialized metabolites (MSM) represent a fascinating realm of chemical diversity with multifaceted functions across the spectrum of life on Earth. These metabolites serve as weapons, metal transporters, regulatory agents, and more. The conservation of genes responsible for their production over extensive evolutionary timescales underscores their selective advantage. Recent decades have witnessed an upsurge in MSM studies, driven by advancements in analytical techniques and the ever-growing accessibility of the aquatic environment. Marine macro and microorganisms offer a rich tapestry of specialized metabolites, some exhibiting potent activities in diverse domains, including medicine. The study of MSM presents several challenges, reflecting the need to separate complex mixtures into individual bioactive metabolites and utilize state-of-the-art extraction methods. Comprehensive structural analysis relies on advanced spectroscopic approaches, including nuclear magnetic resonance and mass spectrometry. These tools are instrumental in unravelling the chemical diversity of MSM and understanding their potential applications. While bioprospecting offers enormous potential, it raises critical challenges concerning sustainability, conservation, and equitable benefit-sharing. International protocols like the Nagoya Protocol seeks to regulate access to and share benefits from genetic resources, with considerable implications for marine bioprospecting. The convergence of advanced metabolomics, metagenomics, and synthetic biology offers promising avenues for accelerating the discovery and sustainable production of MSM, shaping the future of this field. This comprehensive review provides a deep dive into the challenges, methodologies, and emerging trends in studying marine-derived natural products, underscoring the immense potential of MSM for advancing chemical sciences and their transformative applications in diverse areas such as food, medicine, biotechnology, and environmental conservation. By bridging multiple disciplines, the continued exploration and sustainable utilization of these metabolites hold the promise of unlocking new innovations for society's benefit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,005
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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