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Enregistrement W4405056433 · doi:10.1172/jci.insight.185307

Granzyme A as biomarker for diagnosis in tuberculous pleural effusion

2024· article· en· W4405056433 sur OpenAlexaff
Fuxiang Li, Chuanzhi Zhu, Yue Zhang, Fanhui Kong, Ximeng Zhang, Liping Pan, Hongyan Jia, Liang Fu, Yunlong Hu, Guofang Deng, Qianting Yang, Xinchun Chen, Yi Cai

Notice bibliographique

RevueJCI Insight · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePleural and Pulmonary Diseases
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesShenzhen UniversityNatural Science Foundation of Guangdong Province
Mots-clésBiomarkerMedicinePleural effusionGranzyme BInternal medicineMesotheliomaPathologyImmunologyBiologyImmune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUNDCurrent diagnostic tools for tuberculous pleural effusion (TPE) are often inadequate, making accurate diagnosis challenging. Effective identification of TPE is critical for ensuring proper treatment and preventing tuberculosis relapse. This study explored the potential of granzyme A (GZMA) as a biomarker for TPE.METHODSPatients with TPE, malignant pleural effusion (MPE), and parapneumonic pleural effusion (PPE) were recruited into discovery and validation cohorts. The discovery cohort consisted of 200 patients with TPE and 100 patients with MPE, while the validation cohort included 167 patients with TPE, 84 patients with MPE, and 69 patients with PPE.RESULTSIn the discovery cohort, GZMA levels were significantly elevated in TPE compared with MPE, demonstrating 90% sensitivity and 91% specificity at a cutoff of 102.29 ng/mL for effectively distinguishing between the two conditions. In the validation cohort, GZMA maintained high diagnostic performance, distinguishing TPE from MPE with 87% sensitivity and 87% specificity and from PPE with 87% sensitivity and 84% specificity. Incorporating GZMA, lactate dehydrogenase (LDH), and adenosine deaminase (ADA) into a random forest model further improved diagnostic accuracy. In the discovery cohort, this model achieved 92% sensitivity and 100% specificity, and in the validation cohort, it distinguished TPE from MPE with 87% sensitivity and 94% specificity and from PPE with 87% sensitivity and 91% specificity.CONCLUSIONOverall, GZMA is a promising biomarker for diagnosing TPE, with improved accuracy when combined with LDH and ADA, providing a robust tool for timely identification and effective management of patients with TPE.FUNDINGThe study was supported by Science and Technology Project of Shenzhen (KCXFZ20211020163545004, KQTD20210811090219022, JCYJ20220818095610021, JSGG20220822095200001, JCYJ20210324094614038), Shenzhen Medical Research Funding (B2302035, A2302004), Provincial Natural Science Foundation of Guangdong (2022A1515220034), and Shenzhen Third People's Hospital Research Foundation (G2022155).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,377
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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