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Enregistrement W4405125084 · doi:10.1600/036364424x17267811220515

To Lump or to Split? Revision of <i>Cuscuta</i> section <i>Indecorae</i> Using a Combined Morphometric, Phylogenetic, and Host Range Approach

2024· article· en· W4405125084 sur OpenAlexaff
Corey W. Burt, Saša Stefanović, Christopher Fleet, Mihai Costea

Notice bibliographique

RevueSystematic Botany · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversity of TorontoWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeCuscutaSection (typography)Range (aeronautics)Host (biology)BotanyEvolutionary biologyEcologyComputer scienceEngineeringGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract— Cuscuta section Indecorae is an infrageneric clade of Cuscuta subgenus Grammica that originated in North America which includes three species: C. indecora , C. coryli , and C. warneri . Some forms of C. indecora are agricultural weeds, while C. warneri and C. coryli face conservation problems regionally or globally. Cuscuta indecora is a morphologically diverse species with three recognized varieties: C. indecora var. indecora , C. indecora var. longisepala , and C. indecora var. attenuata . Two recent broad-scale molecular phylogenetic studies raised questions about the circumscription of C. indecora and the validity of its infraspecific taxa. Therefore, we conducted an extensive morphometric study, and used DNA sequences from plastid and nuclear ribosomal non-coding regions to reconstruct evolutionary relationships among taxa. In addition, we studied the host range of all taxa using herbarium specimens, bipartite networks, and Venn diagrams. Results from all types of evidence confirmed the circumscription of the three species, but differed on the infraspecific structure of C. indecora . The molecular phylogeny inferred C. indecora as paraphyletic, consisting of two distinct clades, with C. coryli nested within one of them. The morphometric and host range studies uncovered extensive overlaps both among the traditional varieties of C. indecora as well as between the two molecular lineages of C. indecora . Previously, Iva annua had been considered the sole host of C. indecora var. attenuata ( C. attenuata ) and this presumed host specificity was the main criterion for accepting this taxon. We found that the type of C. indecora var. longisepala was also growing on Iva annua , which together with the morphological and genetical similarity, indicates that C. indecora var. attenuata is identical to C. indecora var. longisepala . Overall, considering the lack of morphological, host range, and geographical patterns distinguishing either the current three varieties of C. indecora or the two cryptic lineages, the most appropriate solution is to tentatively recognize C . indecora as variable species without recognizing any infraspecific taxa.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,904
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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