To Lump or to Split? Revision of <i>Cuscuta</i> section <i>Indecorae</i> Using a Combined Morphometric, Phylogenetic, and Host Range Approach
Notice bibliographique
Résumé
Abstract— Cuscuta section Indecorae is an infrageneric clade of Cuscuta subgenus Grammica that originated in North America which includes three species: C. indecora, C. coryli, and C. warneri. Some forms of C. indecora are agricultural weeds, while C. warneri and C. coryli face conservation problems regionally or globally. Cuscuta indecora is a morphologically diverse species with three recognized varieties: C. indecora var. indecora, C. indecora var. longisepala, and C. indecora var. attenuata. Two recent broad-scale molecular phylogenetic studies raised questions about the circumscription of C. indecora and the validity of its infraspecific taxa. Therefore, we conducted an extensive morphometric study, and used DNA sequences from plastid and nuclear ribosomal non-coding regions to reconstruct evolutionary relationships among taxa. In addition, we studied the host range of all taxa using herbarium specimens, bipartite networks, and Venn diagrams. Results from all types of evidence confirmed the circumscription of the three species, but differed on the infraspecific structure of C. indecora. The molecular phylogeny inferred C. indecora as paraphyletic, consisting of two distinct clades, with C. coryli nested within one of them. The morphometric and host range studies uncovered extensive overlaps both among the traditional varieties of C. indecora as well as between the two molecular lineages of C. indecora. Previously, Iva annua had been considered the sole host of C. indecora var. attenuata (C. attenuata) and this presumed host specificity was the main criterion for accepting this taxon. We found that the type of C. indecora var. longisepala was also growing on Iva annua, which together with the morphological and genetical similarity, indicates that C. indecora var. attenuata is identical to C. indecora var. longisepala. Overall, considering the lack of morphological, host range, and geographical patterns distinguishing either the current three varieties of C. indecora or the two cryptic lineages, the most appropriate solution is to tentatively recognize C. indecora as variable species without recognizing any infraspecific taxa.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».