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Enregistrement W4405133646 · doi:10.1101/2024.12.03.626650

Repeated climate-driven dispersal and speciation in peripheral populations of Pleistocene mastodons

2024· preprint· en· W4405133646 sur OpenAlexaffabout
Emil Karpinski, Sina Baleka, Andrew R. Boehm, Tim Fedak, Chris Widga, Hendrik N. Poinar

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensMcMaster UniversityNova Scotia HospitalMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenetic algorithmPleistoceneBiological dispersalGeographyEcologyBiologyPaleontologySociologyPopulationDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Recent ancient DNA work has shed some light on the responses of mastodons to Pleistocene glacial/interglacial cycling but focused primarily on their expansion into Beringia. However, genetics has complicated our understanding of the relationships within Mammut , specifically between Pacific and American mastodon phylogeography and questioned whether these are in fact two separate species or regionally localized morphotypes. Here we expand on both avenues by sequencing and contextualizing the mitochondrial genome of a Pacific mastodon, as well as from several North American eastern specimens throughout the last 800 thousand years. We show that Pacific mastodons fall within a previously established, and deeply divergent mitochondrial clade, extending the range of this species into western Canada and potentially Mexico. We also present evidence for at least three discrete expansion events into northeastern coastal regions (i.e. Nova Scotia and the eastern continental shelf), and identify two new mastodon clades, which contain temporally distinct, but geographically co-occurrent specimens. This work sheds further light on mastodon taxonomy and phylogeography across North America throughout the Pleistocene, highlighting interglacial range expansion into northeastern America mirroring the effects on the western side of the continent (Beringia).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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