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Enregistrement W4405179881 · doi:10.1109/tmi.2024.3512603

Heterogeneous Graph Representation Learning Framework for Resting-State Functional Connectivity Analysis

2024· article· en· W4405179881 sur OpenAlexaff
Guangqi Wen, Peng Cao, Lingwen Liu, Jinzhu Yang, Osmar R. Zai͏̈ane, Fei Wang

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Medical Imaging · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Graph Neural Networks
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésResting state fMRIComputer scienceFunctional connectivityRepresentation (politics)GraphGraph theoryArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Theoretical computer scienceNeuroscienceMathematicsPsychologyCombinatorics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain functional connectivity analysis is important for understanding brain development and brain disorders. Recent studies have suggested that the variations of functional connectivity among multiple subnetworks are closely related to the development of diseases. However, the existing works failed to sufficiently capture the complex correlation patterns among the subnetworks and ignored the learning of heterogeneous structural information across the subnetworks. To address these issues, we formulate a new paradigm for constructing and analyzing high-order heterogeneous functional brain networks via meta-paths and propose a Heterogeneous Graph representation Learning framework (BrainHGL). Our framework consists of three key aspects: 1) Meta-path encoding for capturing rich heterogeneous topological information, 2) Meta-path interaction for exploiting complex association patterns among subnetworks and 3) Meta-path aggregation for better meta-path fusion. To the best of our knowledge, we are the first to formulate the heterogeneous brain networks for better exploiting the relationship between the subnetwork interactions and the mental disease We evaluate BrainHGL on the private center Nanjing Medical University dataset (center NMU) and the public Autism Brain Imaging Data Exchange (ABIDE) dataset. We demonstrate the effectiveness of the proposed model across various disease classification tasks, including major depression disorder (MDD), bipolar disorder (BD) and autism spectrum disorder (ASD) diagnoses. In addition, our model provides deeper insights into disease interpretability, including the critical brain subnetwork connectivities, brain regions and functional pathways. We also identified disease subtypes consistent with previous neuroscientific studies by our model, which benefits the disease identification performance. The code is available at https://github.com/IntelliDAL/Graph/BrainHGL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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