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Enregistrement W4405181185 · doi:10.1158/1538-8514.cancerchem24-a014

Abstract A014: OICR41103: a chemical probe for investigating DCAF1 function and therapeutic potential

2024· article· en· W4405181185 sur OpenAlexaffabout
Mahmoud Noureldin, Serah Kimani, Brian C. Wilson, Levon Halabelian, Rima Al‐awar

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFunction (biology)CancerChemistryComputational biologyBiologyCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract DCAF1 is a multifunctional protein that plays an important role in cellular processes, including protein degradation, cell cycle regulation, and immune function, by serving as a substrate receptor for RING-type CRL4 and the HECT family EDVP E3 ubiquitin ligases. Due to its involvement in various biological pathways and diseases, such as cancer and viral infections, there is a growing need for tools to study and regulate DCAF1 functions. Building upon our previous discovery of OICR-38268, a small-molecule binder of the DCAF1 WD40 domain, we have developed an improved chemical probe, OICR-41103. This compound exhibits enhanced binding affinity and selectivity for the WD40 domain of DCAF1. We successfully crystallized OICR-41103 with the WD40 domain, revealing its binding mode. Our probe binds to the WD40 domain of DCAF1 with a low nanomolar affinity in biophysical assays, and engages this domain in cells at nanomolar concentrations. This work presents a valuable chemical probe for studying DCAF1 function and provides a foundation for future drug discovery efforts, either by directly targeting DCAF1 or leveraging it for PROTAC-based strategies Citation Format: Mahmoud Noureldin, Serah Kimani, Brian Wilson, Levon Halabelian, Rima Al-awar. OICR41103: a chemical probe for investigating DCAF1 function and therapeutic potential. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Optimizing Therapeutic Efficacy and Tolerability through Cancer Chemistry; 2024 Dec 9-11; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(12_Suppl):Abstract nr A014

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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