Abstract PR002: EP300 loss of function is a pan-cancer sensitizer to BET inhibition
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genetically targeted therapies have proven to be a successful approach to treating cancer because they inhibit the causal (driver) biology of tumors that is absent in healthy cells. While targeted therapies exist for most oncogenes, only a small fraction of loss-of-function (LoF) tumor suppressor genes (TSGs) have been drugged to date, despite TSG mutations causing 2/3 of all cancer. Here we report a novel 1st-in-class genetically targeted opportunity using BET inhibitors to treat EP300 LoF cancers. Among the hundreds of pharmacogenetic screens that we have conducted, this interaction is similar to PARP-BRCA1/HRD in significance, and among the strongest we have discovered. It is cancer-type agnostic and holds up with all potent BET inhibitors in various pre-clinical models, including PDXs. Mechanistically, we demonstrate that apoptosis induced by DNA catastrophe arising from pre-mature entry into S phase plays a significant role. BET inhibition blocks timely assembly of DNA replication factors, which leads to G1 arrest in healthy cells; cancer cells that lack p300, a key regulator of CDK2, and CDK7, proceed through G1-S before replication deficiencies can be resolved. EP300 loss of function is a causal driver in more than 25,000 new cancer cases per year in the US and there currently are no genetically targeted options for these patients. This presentation will focus on the discovery, characterization, and clinical re-entry plan for our BET inhibitor LFB-190, to treat EP300 LoF solid tumors. Citation Format: Tomas Babak, Peter Truesdell, Greg Vontz, Peter Heinecke, Doris Coto Villa, Meiou Dai. EP300 loss of function is a pan-cancer sensitizer to BET inhibition. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Optimizing Therapeutic Efficacy and Tolerability through Cancer Chemistry; 2024 Dec 9-11; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(12_Suppl):Abstract nr PR002
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».