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Enregistrement W4405183298 · doi:10.3390/biomedicines12122794

Exploration of Novel Biomarkers for Neurodegenerative Diseases Using Proteomic Analysis and Ligand-Binding Assays

2024· article· en· W4405183298 sur OpenAlexfundno aff
Annalena Kenzelmann, Christina Boch, Ronny Schmidt, Mario Richter, Michael Schulz

Notice bibliographique

RevueBiomedicines · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAbbVie Canada
Mots-clésBiomarkerDiseaseAntibody microarrayOsteopontinBiomarker discoveryMedicineProteomicsParkinson's diseaseMicroarrayMultiple sclerosisBioinformaticsComputational biologyImmunologyAntibodyBiologyPathologyGene expressionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background/Objectives: Neurodegenerative diseases are a major cause of morbidity and mortality worldwide, and their public health burden continues to increase. There is an urgent need to develop reliable and sensitive biomarkers to aid the timely diagnosis, disease progression monitoring, and therapeutic development for neurodegenerative disorders. Proteomic screening strategies, including antibody microarrays, are a powerful tool for biomarker discovery, but their findings should be confirmed using quantitative assays. The current study explored the feasibility of combining an exploratory proteomic strategy and confirmatory ligand-binding assays to screen for and validate biomarker candidates for neurodegenerative disorders. Methods: It analyzed cerebrospinal fluid (CSF) and plasma samples from patients with Alzheimer’s disease, Parkinson’s disease, and multiple sclerosis and healthy controls using an exploratory antibody microarray and validatory ligand-binding assays. Results: The screening antibody microarray identified differentially expressed proteins between patients with neurodegenerative diseases and healthy controls, including cluster of differentiation 14 (CD14), osteopontin, and vascular endothelial growth factor 165b. Quantitative ligand-binding assays confirmed that CD14 levels were elevated in CSF of patients with Alzheimer’s disease (p = 0.0177), whereas osteopontin levels were increased in CSF of patients with Parkinson’s disease (p = 0.0346). Conclusions: The current study demonstrated the potential utility of combining an exploratory proteomic approach and quantitative ligand-binding assays to identify biomarker candidates for neurodegenerative disorders. To further validate and expand these findings, large-scale analyses using well-characterized samples should be conducted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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