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Enregistrement W4405190701 · doi:10.3390/cancers16234116

Prediagnostic Plasma Nutrimetabolomics and Prostate Cancer Risk: A Nested Case–Control Analysis Within the EPIC Study

2024· article· en· W4405190701 sur OpenAlexaff
Enrique Almanza‐Aguilera, Miriam Martínez‐Huélamo, Yamilé López‐Hernández, Daniel Guiñón-Fort, Anna Guadall, Meryl B. Cruz, Aurora Perez‐Cornago, Agnetha Linn Rostgaard‐Hansen, Anne Tjønneland, Christina C. Dahm, Verena Katzke, Matthias B. Schulze, Giovanna Masala, Claudia Agnoli, ­Rosario ­Tumino, Fulvio Ricceri, Cristina Lasheras, Marta Crous‐Bou, María‐José Sánchez, Amaia Aizpurua-Atxega, Marcela Guevara, Konstantinos K. Tsilidis, Anastasia Chrysovalantou Chatziioannou, Elisabete Weiderpass, Ruth C. Travis, David S. Wishart, Cristina Andrés‐Lacueva, Raúl Zamora‐Ros

Notice bibliographique

RevueCancers · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNutritional Studies and Diet
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesSchool of Public Health, Imperial College LondonRijksinstituut voor Volksgezondheid en MilieuInstituto de Salud Carlos IIIAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilInstitut Gustave-RoussyAgencia Estatal de InvestigaciónDeutsche KrebshilfeVetenskapsrådetInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsCancerfondenCancer Research UKWorld Health OrganizationKræftens BekæmpelseUniversiteit UtrechtMutuelle Générale de l'Education NationaleAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroCentro de Investigación Biomédica en Red Fragilidad y Envejecimiento SaludableImperial College LondonDeutsches KrebsforschungszentrumLigue Contre le CancerGeneralitat de CatalunyaEuropean Regional Development FundBundesministerium für Bildung und ForschungNational Institute for Health and Care ResearchCentres de Recerca de CatalunyaInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMinisterie van Volksgezondheid, Welzijn en SportNIHR Imperial Biomedical Research CentreCentre International de Recherche sur le Cancer
Mots-clésNested case-control studyEPICProstate cancerMedicineOncologyCase-control studyCancerInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and Objective: Nutrimetabolomics may reveal novel insights into early metabolic alterations and the role of dietary exposures on prostate cancer (PCa) risk. We aimed to prospectively investigate the associations between plasma metabolite concentrations and PCa risk, including clinically relevant tumor subtypes. Methods: We used a targeted and large-scale metabolomics approach to analyze plasma samples of 851 matched PCa case–control pairs from the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) cohort. Associations between metabolite concentrations and PCa risk were estimated by multivariate conditional logistic regression analysis. False discovery rate (FDR) was used to control for multiple testing correction. Results: Thirty-one metabolites (predominately derivatives of food intake and microbial metabolism) were associated with overall PCa risk and its clinical subtypes (p < 0.05), but none of the associations exceeded the FDR threshold. The strongest positive and negative associations were for dimethylglycine (OR = 2.13; 95% CI 1.16–3.91) with advanced PCa risk (n = 157) and indole-3-lactic acid (OR = 0.28; 95% CI 0.09–0.87) with fatal PCa risk (n = 57), respectively; however, these associations did not survive correction for multiple testing. Conclusions: The results from the current nutrimetabolomics study suggest that apart from early metabolic deregulations, some biomarkers of food intake might be related to PCa risk, especially advanced and fatal PCa. Further independent and larger studies are needed to validate our results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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