Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
RevueNucleic Acids Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of OttawaMcMaster UniversityUniversity of ManitobaSimon Fraser UniversityUniversity of Northern British Columbia
Organismes subventionnairesNational Science Foundation Graduate Research Fellowship ProgramSINTEF IndustriHORIZON EUROPE European Innovation CouncilNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Key Research and Development Program of ChinaEuropean Regional Development FundStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationFundação para a Ciência e a TecnologiaJapan Society for the Promotion of ScienceNational Health and Medical Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHORIZON EUROPE Framework ProgrammeHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institute of Environmental Health SciencesOffice of ScienceH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Agri-Food Biotechnology InstituteDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthKementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan TeknologiAgencia Nacional de Investigación y DesarrolloFulbright AssociationJunta de AndalucíaNovo Nordisk FondenNational Estuarine Research Reserve SystemUniversität des SaarlandesShanghai Jiao Tong UniversityMinistry of Higher Education and Scientific ResearchMinistry of Education, IndiaNational Institute of General Medical SciencesLeids Universitair Medisch CentrumNational Natural Science Foundation of ChinaNational Research Foundation of KoreaDeutsche ForschungsgemeinschaftNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekHans-Fischer-GesellschaftConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaFonds Wetenschappelijk OnderzoekFonds National de la Recherche LuxembourgH2020 European Research CouncilAustralian GovernmentUniversity of SydneyDanmarks GrundforskningsfondU.S. Department of AgricultureSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversiteit LeidenUniversity Grants Commission of BangladeshNational Science FoundationUK Research and InnovationDivision of Chemical, Bioengineering, Environmental, and Transport SystemsDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaDepartment for Environment, Food and Rural Affairs, UK GovernmentMinistry of Education and Science of UkraineWerner Siemens-StiftungLeibniz-GemeinschaftAgence Nationale de la RechercheEmory UniversityMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesGovernment of the United KingdomUniversity Grants CommissionBadan Riset dan Inovasi NasionalNational Research FoundationVlaamse regeringAlexander von Humboldt-StiftungMinistry of Science and ICT, South KoreaNovo NordiskDeutsches Zentrum für InfektionsforschungCarlsbergfondetInnovationsfondenEuropean CommissionFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloLembaga Pengelola Dana PendidikanAustrian Science FundU.S. Department of Energy
Mots-clésBiologyGene clusterData curationCluster (spacecraft)Computational biologyGeneGeneticsData science
Résumé
récupéré en direct d'OpenAlexSpecialized or secondary metabolites are small molecules of biological origin, often showing potent biological activities with applications in agriculture, engineering and medicine. Usually, the biosynthesis of these natural products is governed by sets of co-regulated and physically clustered genes known as biosynthetic gene clusters (BGCs). To share information about BGCs in a standardized and machine-readable way, the Minimum Information about a Biosynthetic Gene cluster (MIBiG) data standard and repository was initiated in 2015. Since its conception, MIBiG has been regularly updated to expand data coverage and remain up to date with innovations in natural product research. Here, we describe MIBiG version 4.0, an extensive update to the data repository and the underlying data standard. In a massive community annotation effort, 267 contributors performed 8304 edits, creating 557 new entries and modifying 590 existing entries, resulting in a new total of 3059 curated entries in MIBiG. Particular attention was paid to ensuring high data quality, with automated data validation using a newly developed custom submission portal prototype, paired with a novel peer-reviewing model. MIBiG 4.0 also takes steps towards a rolling release model and a broader involvement of the scientific community. MIBiG 4.0 is accessible online at https://mibig.secondarymetabolites.org/.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,378
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
