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Enregistrement W4405234630 · doi:10.1016/j.idm.2024.12.005

State-space modelling for infectious disease surveillance data: Dynamic regression and covariance analysis

2024· article· en· W4405234630 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueInfectious Disease Modelling · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsSanofi
Mots-clésCovarianceStatisticsInfectious disease (medical specialty)Regression analysisGeographyState spaceComputer scienceMathematicsDiseaseMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We analyze COVID-19 surveillance data from Ontario, Canada, using state-space modelling techniques to address key challenges in understanding disease transmission dynamics. The study applies component linear Gaussian state-space models to capture periodicity, trends, and random fluctuations in case counts. We explore the relationships between COVID-19 cases, hospitalizations, workdays, and wastewater viral loads through dynamic regression models, offering insights into how these factors influence public health outcomes. Our analysis extends to multivariate covariance estimation, utilizing a novel methodology to provide time-varying correlation estimates that account for non-stationary data. Results demonstrate the significance of incorporating environmental covariates, such as wastewater data, in improving model robustness and uncovering the complex interplay between epidemiological factors. This work highlights the limitations of simpler models and emphasizes the advantages of state-space approaches for analyzing dynamic infectious disease data. By illustrating the application of advanced modelling techniques, this study contributes to a deeper understanding of disease transmission and informs public health interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle