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Enregistrement W4405280961 · doi:10.1111/syen.12662

Gastritis over <i>Gastrisus</i> Sharp (Coleoptera: Staphylinidae: Xanthopygina): Resolving a major taxonomic impediment with phylogenomics

2024· article· en· W4405280961 sur OpenAlexaff
Adam Brunke, Stylianos Chatzimanolis

Notice bibliographique

RevueSystematic Entomology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueColeoptera Taxonomy and Distribution
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesUniversity of Tennessee at Chattanooga
Mots-clésBiologyPhylogenomicsZoologyEcologyPhylogeneticsClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract With 334 species, the subtribe Xanthopygina forms a diverse and ecologically dominant component of the Neotropical beetle fauna, ranging from the southern United States south to Argentina. Species can be abundant in a variety of microhabitats and are frequently encountered in tropical forests. Although a number of morphologically distinct genera are now well defined and identifiable, the subtribe still suffers from several poorly defined genera with relatively generalized morphology. The worst of these is the genus Gastrisus Sharp, which has never had a morphological definition per se and has, over time, accumulated many morphologically disparate species. This nebulous concept of Gastrisus has further made it difficult to generically assign and describe new species. Here we assembled a phylogenomic dataset using anchored hybrid enrichment across a broad sample of Xanthopygina, including nearly all described genera, a representation of morphological variation within Gastrisus and a number of undescribed taxa we were unable to assign to a genus. Both maximum likelihood and coalescent analyses converged on a well resolved and stable topology for the subtribe, which will serve as a critical framework for continued taxonomic progress in Xanthopygina. Nine major lineages were identified, most congruent with previous work. The limits of Gastrisus were successfully identified, and the monophyletic core of the genus was recovered as sister to a redefined Nausicotus Sharp, which included Torobus syn. n. Several large species of Gastrisus were resolved as a clade of the Xanthopygus group and are here placed in Drepanagrios gen. n. An additional six new genera were discovered but will be described and treated in detail in future papers. In addition to Gastrisus , Phanolinus Sharp, Xenopygus Bernhauer, Phanolinopsis Scheerpeltz and Ocyolinus Sharp were recovered as paraphyletic, resulting in Elecatopselaphus syn. n. ( =Phanolinus ), the re‐validation of Leptodiastemus Bernhauer stat. ressur. and the redefinition of Xenopygus , Phanolinopsis and Ocyolinus . We propose Phanolinus scheerpeltzi nom. n. as a replacement name for Phanolinus peruvianus (Scheerpeltz 1972, nec Bernhauer 1917) (previously Elecatopselaphus ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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