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Enregistrement W4405285081 · doi:10.1016/j.envexpbot.2024.106076

Transcriptome analysis and physiological response to heat and cold stress in flax (Linum usitatissimum L) at the seedling stage

2024· article· en· W4405285081 sur OpenAlexaff
Qian Zhao, Shuyao Li, Fu Wang, Jianyu Lu, Guo‐Fei Tan, Ningning Wang, Fan Qi, Changjiang Zhang, Michael K. Deyholos, Zhenyuan Zang, Jun Zhang, Jian Zhang

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Experimental Botany · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesJiangsu Provincial Department of Human Resources and Social SecurityJilin Agricultural University
Mots-clésLinumSeedlingBiologyTranscriptomeBotanyFight-or-flight responseCold stressBiochemistryGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Exposure to low temperatures renders flax seedlings vulnerable to oxidative damage, leading to delayed flowering, while high temperatures hinder seedling growth and negatively impact pollen viability. The seedling stage is particularly sensitive to environmental stressors, which can result in decreased flax yield and compromised seed oil quality. In this study, phenotypic assessments, along with physiological, biochemical, and transcriptomic analyses, were conducted on flax plants subjected to both high and low temperature stress, followed by 6 d recovery period. Results showed that the length and weight of seedlings and shoots were greatest in flax plants that had recovered from low temperature stress. After exposure to low temperature stress, flax seedlings exhibited the highest relative water content (RWC) and relative water loss (RWL) measuring 66.56% and 93.34%, respectively. The levels of Pro, SOD, CAT, POD, and nine phytohormones were significantly elevated compared to the control, whereas MDA levels were notably declined. A total of 43,471 genes were identified in the transcriptome data, Among these 32,319 exhibited sighificant differential expression. GO analysis highlighted enrichment in biological processes, cellular components, and molecular functions. KEGG analysis showed enrichment in plant hormone signal transduction and secondary metabolite biosynthesis. Moreover, differentially expressed genes associated with phytohormone synthesis and signal transduction were analyzed. The expression level of salicylic acid (SA) genes was significantly upregulated under high temperature stress, whereas jasmonic acid (JA) genes were significantly up-regulated under low temperature stress. These findings will elucidate the intricate regulatory mechanisms of osmoregulatory factors, antioxidant enzymes, and endogenous plant hormones in flax's response to high and low temperature stress, offering valuable insights for the selection and breeding of resistant flax varieties and the enhancement of genetic resources. • Flax ( Linum usitatissimum L.) is one of the most important oil and economic crops in China. • Temperature is crucial throughout the growth and development of plants. • Genes related to jasmonic acid (JA) exhibited significant up-regulation under low-temperature stress. • Genes related to salicylic acid (SA) exhibited significant up-regulation under high-temperature stress. • This finding deepen our understanding of flax seedlings response to temperature stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,748
Score d'incertitude au seuil0,689

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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