Systematic analysis of WOX transcription factor family in the biodiesel tree Lindera glauca and functional characterization of LgWOX24 in root development
Notice bibliographique
Résumé
The WUSCHEL-related homeobox (WOX) gene family is vital for plant growth and development. Despite its importance, more research is needed on the WOXs in economically significant species like Lindera glauca , a tree with oil-rich fruits and potential as a biodiesel feedstock. Understanding the WOX family in L. glauca could enhance its economic value, yet a comprehensive analysis is needed, leaving a gap in our knowledge of these genes' roles. Here, we performed a genome-wide analysis to identify and characterize the WOX family in L. glauca . We identified 30 LgWOXs , categorized into three clades. Sequence alignment confirmed that these LgWOX proteins have a conserved structure, suggesting similar functions. Synteny and chromosomal distribution analyses indicated that both whole-gene and segmental duplications contributed to the expansion of the LgWOX family. Expression pattern analysis revealed that LgWOX3 and LgWOX24 are predominantly expressed in L. glauca roots, indicating a role in root development. Transient overexpression of LgWOX24 resulted in reduced expression of genes related to hormone polar transport and increased levels of abscisic acid regulators, suggesting that LgWOX24 negatively regulates root growth. These findings provide insights into the roles of WOXs in L. glauca , particularly in root development. By elucidating the function of LgWOX24 , this study lays the groundwork for future bioengineering efforts to optimize root growth, potentially enhancing L. glauca 's utility as a biodiesel feedstock and its broader agricultural applications. • Thirty WOXs were identified in the Lindera glauca genome. • Transcription levels of LgWOXs varied significantly across different tissues. • Whole-gene and segmental duplications contributed to the expansion of LgWOXs family. • LgWOXs expressed specifically in roots are localized in the nucleus. • LgWOX24 negatively regulates root growth in L. glauca .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».