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Enregistrement W4405289337 · doi:10.14740/wjon1960

Causal Relationships Between Gut Microbiota, Immune Cell and Pancreatic Cancer: A Two-Step, Two-Sample Mendelian Randomization Study

2024· article· en· W4405289337 sur OpenAlexvenueno aff
S. Wang, Ming Zhang, Ting Yu, Rui Lei, Qiu Li

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMendelian randomizationMedicineImmune systemPancreatic cancerMendelian inheritanceCancerRandomizationOncologyImmunologyInternal medicineBioinformaticsGeneticsClinical trialGeneBiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Gut microbiota (GM) is associated with both the occurrence and development of pancreatic cancer (PC), and immune cells potentially play a role in this process. This study sought to evaluate the causative effect of GM on PC and to ascertain possible immune cell mediators. Methods: The study primarily employed a two-step, two-sample Mendelian randomization (MR) analysis to explore the causal relationship between GM and PC within the European population, placing particular emphasis on the application of the inverse variance weighted (IVW) approach. Additionally, mediation analysis was conducted to explore the potential influence of immune cells as mediators. Results: The MR analysis revealed a significant association between Geminocystis and the risk of PC. Increased abundance of Geminocystis was positively associated with the risk of PC (odds ratio (OR): 2.580, 95% confidence interval (CI): 1.050 - 6.342). The validity of the outcomes was also verified by the sensitivity analysis. The mediation MR analysis showed that the B-cell absolute count served as a partial intermediary in the causal link between Geminocystis and the risk of PC, contributing to 15.321% of the mediating impact. Conclusion: This MR study demonstrated that Geminocystis has a causal relationship with PC and potentially mediates B-cell absolute count in the TBNK panel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,033
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,045
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,173

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0330,045
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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