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Enregistrement W4405398606 · doi:10.1093/jxb/erae486

Catalytically inactive subgroup VIII receptor-like cytoplasmic kinases regulate the immune-triggered oxidative burst in <i>Arabidopsis thaliana</i>

2024· article· en· W4405398606 sur OpenAlexafffund
Márcia Gonçalves Dias, Thakshila Dharmasena, Carmen Gonzalez-Ferrer, Jan Eric Maika, Virginia Natalí Miguel, Ruoqi Dou, M. C. Rodriguez Gallo, Melissa Bredow, Kristen R. Siegel, Rüdiger Simon, Jacqueline Monaghan

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of AlbertaQueen's University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaQueen's UniversityFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of AlbertaUniversities Space Research Association
Mots-clésArabidopsisArabidopsis thalianaKinasePhosphorylationBiologySignal transductionCell biologyProtein kinase AMutantBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein kinases are key components of multiple cell signaling pathways. Several receptor-like cytoplasmic kinases (RLCKs) have demonstrated roles in immune and developmental signaling across various plant species, making them of interest in the study of phosphorylation-based signal relay. Here, we present our investigation of a subgroup of RLCKs in Arabidopsis thaliana. Specifically, we focus on subgroup VIII RLCKs: MAZ and its paralog CARK6, as well as CARK7 and its paralog CARK9. We found that both MAZ and CARK7 associate with the calcium-dependent protein kinase CPK28 in planta and, furthermore, that CPK28 phosphorylates both MAZ and CARK7 on multiple residues in areas that are known to be critical for protein kinase activation. Genetic analysis suggested redundant roles for MAZ and CARK6 as negative regulators of the immune-triggered oxidative burst. We provide evidence that supports homo- and heterodimerization between CARK7 and MAZ, which may be a general feature of this subgroup. Multiple biochemical experiments indicated that neither MAZ nor CARK7 demonstrate catalytic protein kinase activity in vitro. Interestingly, we found that a mutant variant of MAZ incapable of protein kinase activity can complement maz-1 mutants, suggesting non-catalytic roles of MAZ in planta. Overall, our study identifies subgroup VIII RLCKs as new players in Arabidopsis immune signaling and highlights the importance of non-catalytic functions of protein kinases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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