Genetic Mapping of the Powdery Mildew Resistance Gene <i>Pm13</i> on Oat ( <scp> <i>Avena sativa</i> </scp> ) Chromosome 1D
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Powdery mildew, caused by the biotrophic fungus Blumeria graminis DC. f. sp. avenae , is a widespread disease of oats, especially in the temperate regions of Western and Central Europe, and the use of resistant varieties is the most sustainable way to ensure stable yields. Therefore, the identification of robust and effective resistance to powdery mildew is of great interest for oat breedinpg. In contrast to race‐specific resistance genes, adult plant resistance (APR) is generally considered to be more durable. The oat variety ‘Firth’, as well as related varieties such as ‘Husky’ or ‘Flämingstip’, contains an unknown APR gene, which was previously located on chromosome 1D using DArT markers. The aim of this study was to confirm and refine the chromosomal location of this resistance gene, tentatively named Pm13 . To this end, two independent experiments were carried out using different genetic material under natural infection conditions in the field: genome‐wide association mapping (GWAS) in a diverse set of 250 oat lines grown in 10 environments and QTL mapping in a HuskyxAVE1284 biparental population grown in three environments. Both approaches identified a QTL for powdery mildew resistance on the distal end of chromosome 1D in the hexaploid Sang oat genome. The locus explained up to 15% of the phenotypic variance in GWAS and 64% of the phenotypic variance in QTL mapping. Comparison of field data with results from laboratory leaf segment tests confirmed that Pm13 does indeed confer APR. The sequence information of the identified linked markers may allow the development of molecular markers useful for early selection of oat lines with high levels of APR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».