MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405466240 · doi:10.24272/j.issn.2095-8137.2024.391

Consistency, distinction, and potential metabolic crosstalk of nitrogen mobilization-related genes in silk production and silk gland biology

2024· article· en· W4405466240 sur OpenAlexaff
Meiyan Yi, Yang Xu, Man Wang

Notice bibliographique

Revue动物学研究 · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSilk-based biomaterials and applications
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesSouth China Normal UniversityChinese Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSILKCrosstalkBiologyProduction (economics)Polymer scienceMaterials scienceEngineeringComposite materialEconomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The domesticated silkworm (<italic>Bombyx mori</italic>) has evolved a highly efficient nitrogen utilization system to support silk production. The silk glands play a pleiotropic role in sequestering nitrogen resources for silk synthesis, mitigating aminoacidemia by assimilating free amino acids, and reallocating nitrogen during metamorphosis through programmed cell death. However, the specific functions of nitrogen metabolism-related genes in this process remain unclear. Using CRISPR/Cas9-based gene editing, mutations were generated in glutamine synthetase (<italic>GS</italic>), glutamate synthetase (<italic>GOGAT</italic>), asparagine synthetase (<italic>AS</italic>), glutamate dehydrogenase (<italic>GDH</italic>) and glutamate oxaloacetate transaminase 1 (<italic>GOT1</italic>). Disruption of <italic>GS</italic>, <italic>GOGAT</italic>, and <italic>AS</italic> consistently reduced silkworm cocoon and pupal weight and significantly down-regulated silk protein gene transcription, whereas <italic>GOT1</italic> mutation had no such effect. <italic>GOGAT</italic> mutants exhibited abnormally enlarged silk glands, whereas <italic>GS</italic> and <italic>AS</italic> mutants showed delayed programmed cell death in the silk glands. In contrast, <italic>GOT1</italic> mutants displayed normal silk gland morphology but were consistently smaller. Disruption of <italic>GS</italic>, <italic>GOGAT</italic>, and <italic>AS</italic> led to more extensive transcriptional changes, including altered expression of transcription factors in the silk glands, compared with <italic>GOT1</italic> mutants. Both <italic>GS</italic> and <italic>GOGAT</italic> mutants exhibited up-regulation of <italic>AS</italic> and <italic>GDH</italic>, while only <italic>GOGAT</italic> mutants displayed elevated AS enzymatic activity, suggesting that GOGAT may compete with AS for glutamine in the silk glands to support silk protein synthesis. <italic>AS</italic> mutants showed significantly elevated GOT activity and up-regulation of several metabolic pathways, indicating that AS may functionally interact with GOT in regulating both silk gland development and programmed cell death during metamorphosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,343

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revue动物学研究Même sujetSilk-based biomaterials and applicationsTravaux en français237 207