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Enregistrement W4405583934 · doi:10.1111/all.16429

Food Allergy Genetics and Epigenetics: A Review of Genome‐Wide Association Studies

2024· review· en· W4405583934 sur OpenAlexafffund
Aleix Arnau‐Soler, Bénédicte L. Tremblay, Yidan Sun, Anne‐Marie Madore, Mathieu Simard, Elin T.G. Kersten, Ahla Ghauri, Ingo Marenholz, Thomas Eiwegger, Elinor Simons, Edmond S. Chan, Kari C. Nadeau, Vanitha Sampath, Bruce Mazer, Susan J. Elliott, Christine Hampson, Lianne Soller, Andrew J. Sandford, Philippe Bégin, Jennie Hui, B. Wilken, Jennifer Gerdts, Adrienn N. Bourkas, Anne K. Ellis, Denitsa Vasileva, Ann E. Clarke, Aïda Eslami, Moshe Ben‐Shoshan, David Martino, Denise Daley, Gerard H. Koppelman, Catherine Laprise, Young‐Ae Lee, Yuka Asai

Notice bibliographique

RevueAllergy · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryQueen's UniversityUniversité LavalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of WaterlooMcGill University Health CentreUniversity of ManitobaAllerGenHospital for Sick ChildrenUniversité du Québec à ChicoutimiChildren's Hospital Research Institute of ManitobaMontreal Children's HospitalUniversity of TorontoSickKids FoundationUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAbbVie CanadaRegeneron PharmaceuticalsNational Institutes of HealthLEO PharmaSanofi GenzymePfizerIncyteEuropean Food Safety AuthoritySun PharmaNational Heart, Lung, and Blood InstituteHospital for Sick ChildrenUniversité du Québec à ChicoutimiCanadian Institutes of Health ResearchNovartis PharmaDanoneCanadian Dermatology FoundationSanofiTeva Pharmaceutical IndustriesNovartisAimmune TherapeuticsAstraZenecaEli Lilly and CompanyBristol-Myers Squibb
Mots-clésEpigeneticsGenome-wide association studyGenetic associationFood allergyEpigenomeAllergyBiologyAtopic dermatitisDiseaseContext (archaeology)GeneticsImmunologyMedicineGeneDNA methylationSingle-nucleotide polymorphismGenotypeGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In this review, we provide an overview of food allergy genetics and epigenetics aimed at clinicians and researchers. This includes a brief review of the current understanding of genetic and epigenetic mechanisms, inheritance of food allergy, as well as a discussion of advantages and limitations of the different types of studies in genetic research. We specifically focus on the results of genome‐wide association studies in food allergy, which have identified 16 genetic variants that reach genome‐wide significance, many of which overlap with other allergic diseases, including asthma, atopic dermatitis, and allergic rhinitis. Identified genes for food allergy are mainly involved in epithelial barrier function (e.g., FLG , SERPINB7 ) and immune function (e.g., HLA , IL4 ). Epigenome‐wide significant findings at 32 loci are also summarized as well as 14 additional loci with significance at a false discovery of < 1 × 10 −4 . Integration of epigenetic and genetic data is discussed in the context of disease mechanisms, many of which are shared with other allergic diseases. The potential utility of genetic and epigenetic discoveries is deliberated. In the future, genetic and epigenetic markers may offer ways to predict the presence or absence of clinical IgE‐mediated food allergy among sensitized individuals, likelihood of development of natural tolerance, and response to immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,853
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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