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Enregistrement W4405628548 · doi:10.1101/2024.12.18.629254

Transient receptor potential vanilloid channel 2 contributes to multi-modal endoplasmic reticulum and perinuclear space dilations that can also be observed in prion-infected mice

2024· preprint· en· W4405628548 sur OpenAlexaff
Wenda Zhao, Shehab Eid, Chris Sackmann, Declan Williams, Xinzhu Wang, Yunqing Ouyang, Thomas Zerbes, Gerold Schmitt‐Ulms

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumTransient receptor potential channelTransient (computer programming)NeuroscienceCell biologyReceptorPhysicsChemistryBiologyComputer scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Our recent work on the prion protein and Na + ,K + -ATPases (NKAs) led us to revisit data from over 50 years ago, which suggested a similarity between vacuolation phenotypes in rodents poisoned with cardiac glycosides (CGs) and spongiform degeneration in prion disease. At that time, this hypothesis was dismissed because the vacuolation observed in prion diseases affects neurons, whereas CG poisoning in rodent brains led to swellings of the endoplasmic reticulum (ER) in astrocytes. We speculated that this difference might be specific to rodents and document here that the vacuolation shifts to neurons in mice expressing a humanized NKA α1 subunit. Next, we investigated the molecular mechanisms that could cause similar ER vacuolation in human cells in vitro . We found that certain stressors—such as overexpression of NKA α subunits and exposure to specific toxins known to trigger the unfolded protein response—can induce a phenotype characterized by profound ER dilation that is most strikingly observed for the perinuclear space (PNS). The ion imbalance typically caused by functional NKAs does not contribute to this phenotype. In fact, it can occur even with the overexpression of catalytically inactive NKAs. Several lines of evidence, generated with pharmacological agents, ion-specific dyes, antagonists, and truncated expression constructs, suggest a calcium leak channel in the ER, known as transient receptor potential vanilloid 2 (TRPV2), plays a role in this ER and PNS dilation. Additionally, we observed that the formation of these vacuoles coincides with a decrease in steady-state levels of the lipid kinase PIKFYVE, which is recognized for its role in endolysosomal fission and fusion processes. Finally, we found evidence of vacuoles in cryo-sectioned brains of prion-infected mice that can be filled with a fluorescent marker targeted to the ER and PNS. This raises the possibility that this vacuolation phenomenon contributes to spongiform degeneration seen in prion diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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