MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405635140 · doi:10.1128/mra.01058-24

Complete genome sequence of <i>Chryseobacterium</i> sp. strain KCF3-3, isolated from the body surface of channel catfish, <i>Ictalurus punctatus</i>

2024· article· en· W4405635140 sur OpenAlexfundno aff
Miho Kojima, Kaho Tobioka, Mika Okazaki, Kiyonobu Yokota, Dien Arista Anggorowati, Hajime Nakatani, Katsutoshi Hori, Yutaka Tamaru, Fumiyoshi Okazaki

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Resource Announcements · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJST-Mirai ProgramJapan Science and Technology AgencyMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésIctalurusCatfishStrain (injury)Whole genome sequencingOpen reading frameBiologyIctaluridaeGenomeGeneticsGeneAnatomyFish <Actinopterygii>FisheryPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Here, we report the complete genome sequence of Chryseobacterium sp. strain KCF3-3, isolated from the body surface of channel catfish, Ictalurus punctatus . The de novo assembly revealed a chromosome size of 5,623,437 bp with an estimated 4,939 open reading frames.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,936
Score d'incertitude au seuil0,964

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiology Resource AnnouncementsMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207