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Enregistrement W4405639398 · doi:10.1080/00268976.2024.2436095

Rational design of novel potential EGFR inhibitors: molecular docking, molecular descriptor and pharmacokinetics studies of piperidin-4-one derivatives

2024· article· en· W4405639398 sur OpenAlexaff
M. Saritha, D. Rajaraman, S. Sonadevi, Tony Augustine, Jain Maria Thomas, L. Athishu Anthony

Notice bibliographique

RevueMolecular Physics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthesis and biological activity
Établissements canadiensSt. Peter's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDocking (animal)ChemistryPharmacokineticsRational designMolecular modelComputational chemistryCombinatorial chemistryStereochemistryPharmacologyComputational biologyNanotechnologyMaterials scienceMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The epidermal growth factor receptor (EGFR) is one of the most attractive drug targets against the human pancreas cancer cell line (Panc-1). In this research, Piperidin-4-one derivative is identified as novel potential EGFR inhibitors were subjected to molecular docking, molecular descriptor and pharmacokinetics studies in order to design new compound with high predicted activity. Using the 6-311G (d, p) basis set, the density functional theory (DFT) B3LYP method was utilised to calculate the optimal structure of the compound 1-(cyclopropanecarbonyl)−2,6-di(1H-indol-3-yl)−3-methylpiperidin-4-one (CIMP). The experimental bond length and bond angles were then compared with the data obtained from the reference compound. The electron densities of the donor (i) and acceptor (j) bonds and the hyper conjugative interaction energy E(2) were found using natural bonding orbital (NBO) analysis. The band gap energy value was found in calculations of the highest occupied molecular orbital (HOMO) and lowest unoccupied molecular orbital (LUMO). Analysis has been done on molecular electrostatic potential. At the same theoretical level, the Mulliken atomic charges of the carbon, nitrogen and oxygen atoms were computed. The good nonlinear optical (NLO) property of the title molecule is demonstrated by the dipole moment, polarizability and first-order hyperpolarizability. The properties of partial density of states (PDOS), total density of states (TDOS) and thermodynamics were computed and discussed separately. Furthermore, statistical analyses were performed to elucidate the relationships between ADMET (Absorption, distribution, Metabolism, Elimination and Toxicity) properties of CIMP and molecular descriptors, including degree, neighborhood degree, degree entropy, and neighborhood degree entropy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,191
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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