MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405640528 · doi:10.1158/2159-8290.cd-24-1366

Multimodal Spatial Profiling Reveals Immune Suppression and Microenvironment Remodeling in Fallopian Tube Precursors to High-Grade Serous Ovarian Carcinoma

2024· article· en· W4405640528 sur OpenAlexfundno aff
Tanjina Kader, Jia‐Ren Lin, Clemens B. Hug, Shannon Coy, Yu‐An Chen, Ino de Bruijn, Natalie Shih, Euihye Jung, Roxanne J. Pelletier, Mariana Lopez Leon, Gabriel Mingo, Dalia K. Omran, Jong Suk Lee, Clarence Yapp, Baby A. Satravada, Ritika Kundra, Yilin Xu, Sabrina Chan, Juliann B. Tefft, Jeremy L. Muhlich, Sarah H. Kim, Stefan M. Gysler, Judith Agudo, James R. Heath, Nikolaus Schultz, Charles W. Drescher, Peter K. Sorger, Ronny Drapkin, Sandro Santagata

Notice bibliographique

RevueCancer Discovery · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOvarian cancer diagnosis and treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteLudwig Center at HarvardGray FoundationPrairie Improvement NetworkU.S. Department of DefenseDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteHonorable Tina Brozman FoundationCanary FoundationDr. Miriam and Sheldon G. Adelson Medical Research Foundation
Mots-clésImmune systemSerous fluidCancer researchBiologyTumor microenvironmentFallopian tubeCarcinogenesisOvarian carcinomaOvarian cancerCancerImmunologyPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) originates from fallopian tube (FT) precursors. However, the molecular changes that occur as precancerous lesions progress to HGSOC are not well understood. To address this, we integrated high-plex imaging and spatial transcriptomics to analyze human tissue samples at different stages of HGSOC development, including p53 signatures, serous tubal intraepithelial carcinomas (STIC), and invasive HGSOC. Our findings reveal immune modulating mechanisms within precursor epithelium, characterized by chromosomal instability, persistent IFN signaling, and dysregulated innate and adaptive immunity. FT precursors display elevated expression of MHC class I, including HLA-E, and IFN-stimulated genes, typically linked to later-stage tumorigenesis. These molecular alterations coincide with progressive shifts in the tumor microenvironment, transitioning from immune surveillance in early STICs to immune suppression in advanced STICs and cancer. These insights identify potential biomarkers and therapeutic targets for HGSOC interception and clarify the molecular transitions from precancer to cancer. SIGNIFICANCE: This study maps the immune response in FT precursors of HGSOC, highlighting localized IFN signaling, chromosomal instability, and competing immune surveillance and suppression along the progression axis. It provides an explorable public spatial profiling atlas for investigating precancer mechanisms, biomarkers, and early detection and interception strategies. See related commentary by Recouvreux and Orsulic, p. 1093.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer DiscoveryMême sujetOvarian cancer diagnosis and treatmentTravaux en français237 207