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Enregistrement W4405663975 · doi:10.1016/j.omtn.2024.102442

Glutamine missense suppressor transfer RNAs inhibit polyglutamine aggregation

2024· article· en· W4405663975 sur OpenAlexafffund
Rasangi Tennakoon, Teija M.I. Bily, Farah Hasan, Sunidhi Syal, Aaron Voigt, Tuğçe B. Balcı, Kyle Hoffman, Patrick O’Donoghue

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Nucleic Acids · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensBioinformatics Solutions (Canada)Western University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsWestern UniversitySchulich School of Medicine and DentistryHuntington Society of Canada
Mots-clésMissense mutationSuppressorGlutamineChemistryCell biologyBiologyMutationBiochemistryAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Huntington's disease (HD) is caused by polyglutamine (polyQ) repeat expansions in the huntingtin gene. HD-causative polyQ alleles lead to protein aggregation, which is a prerequisite for disease. Translation fidelity modifies protein aggregation, and several studies suggest that mutating one or two glutamine (Gln) residues in polyQ reduces aggregation. Thus, we hypothesized that missense suppression of Gln codons with other amino acids will reduce polyQ aggregate formation in cells. In neuroblastoma cells, we assessed tRNA variants that misread Gln codons with serine (tRNASerC/UUG) or alanine (tRNAAlaC/UUG). The tRNAs with the CUG anticodon were more effective at suppressing the CAG repeats in polyQ, and serine and alanine mis-incorporation had differential impacts on polyQ. The expression of tRNASerCUG reduced polyQ protein production as well as both soluble and insoluble aggregate formation. In contrast, cells expressing tRNAAlaCUG selectively decreased insoluble polyQ aggregate formation by 2-fold. Mass spectrometry confirmed Ala mis-incorporation at an average level of ∼20% per Gln codon. Cells expressing the missense suppressor tRNAs showed no cytotoxic effects and no defects in growth or global protein synthesis levels. Our findings demonstrate that tRNA-dependent missense suppression of Gln codons is well tolerated in mammalian cells and significantly reduces polyQ levels and aggregates that cause HD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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