HIV-2 drug resistance genotyping and viral load among HIV-2 infected adults inBurkina Faso, West Africa
Notice bibliographique
Résumé
HIV-2 infection although less virulent compared to HIV-1 is endemic in many parts of West Africa. In Burkina Faso, few data exist on HIV-2 genotypic resistance. The objective of this study was to assess HIV-2 genotypic resistance and viral load in adult patients infected with HIV-2 in Burkina Faso. This was a cross-sectional study that ran from February 2017 to March 2019. This study included 91 HIV-infected adult patients on ARV treatment. HIV and hepatitis B and C status were confirmed by serological tests. HIV-2 viral load and HIV-2 clusters were determined by in-house tests. The mean age was 58.99 ±8.66 years. Of the patients, 12.1% were HIV-1, 73.6% were HIV-2 and 14.3% were co-infected with HIV-1/HIV-2. Only 15% had a high viral load (more than 1000 copies/mL). Groups A and B were detected in this study with the majority being group A (23.75%). HIV-2 subtype CRF01_AB was found in 3.75% of HIV-2 patients. Of the 34 HIV-2 patients whose subtypes were determined, only 7 had reverse transcriptase and 3 had protease resistance mutations. The M184V mutation was the most detected. This study revealed recent data on the status of HIV-2 genotypic resistance in Burkina Faso. Although few HIV-2 infected patients on ARV treatment have developed resistance, it is important to establish a surveillance system for HIV-2 genotypic resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».