MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405730830 · doi:10.1021/acsfoodscitech.4c00896

Automated Beer Analysis by NMR Spectroscopy

2024· article· en· W4405730830 sur OpenAlexafffund
Brian L. Lee, Fatemeh Shahin, Alyaa Selim, Mark Berjanskii, Claudia Torres-Calzada, K. Prashanthi, Rupasri Mandal, David S. Wishart

Notice bibliographique

RevueACS Food Science & Technology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensThe Metabolomics Innovation CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationNational Center for Complementary and Integrative HealthGenome CanadaAlberta InnovatesOffice of Dietary Supplements
Mots-clésProfiling (computer programming)Nuclear magnetic resonance spectroscopyProton NMRNMR spectra databaseChemistryAnalytical Chemistry (journal)Spectral lineComputer scienceChromatographyPhysicsStereochemistryProgramming language

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, we reported on the development of MagMet, a tool capable of automatically processing and quantifying 1D 1 H NMR spectra of complex chemical mixtures, including biofluids such as human serum or plasma and, more recently, beverages such as wine. In this article, we present an extension of MagMet, called MagMet-B, for the automated profiling of 1D 1 H NMR spectra of beer. We curated a comprehensive 1D 1 H NMR spectral library comprising 81 more abundant metabolites commonly found in beer samples and optimized the MagMet algorithm to accurately fit these compounds. A comparison with manual profiling using the Chenomx NMR Suite (Version 8.3) showed a strong correlation between the manually measured and automated MagMet metabolite concentrations, with a mean absolute percent error of 13% and a median absolute percent error of 9%. Time-to-process comparisons show that MagMet-B is up to 45× faster than manual analysis. The MagMet-B Web server, which is specifically tailored for profiling beer NMR spectra at 700 MHz, is now accessible at https://magmet.ca .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueACS Food Science & TechnologyMême sujetMetabolomics and Mass Spectrometry StudiesTravaux en français237 207