Identification of <i>Pappa</i> and <i>Sall3</i> as Gli3 direct target genes acting downstream of cilia signaling in corticogenesis
Notice bibliographique
Résumé
The cerebral cortex is critical for advanced cognitive functions and relies on a vast network of neurons to carry out its highly intricate neural tasks. Generating cortical neurons in accurate numbers hinges on cell signaling orchestrated by primary cilia to coordinate the proliferation and differentiation of cortical stem cells. While recent research has shed light on multiple ciliary roles in corticogenesis, specific mechanisms downstream of cilia signaling remain largely unexplored. We previously showed that an excess of early-born cortical neurons in mice mutant for the ciliary gene Inpp5e was rescued by re-introducing Gli3 repressor. By comparing expression profiles between Inpp5e and Gli3 mutants, we here identified novel Gli3 target genes. This approach highlighted the transcription factor gene Sall3 and Pappalysin1 (Pappa), a metalloproteinase involved in IGF signaling, as upregulated genes in both mutants. Further examination revealed that Gli3 directly binds to Sall3 and Pappa enhancers and suppresses their activity in the dorsal telencephalon. Collectively, our analyses provide important mechanistic insights into how primary cilia govern the behavior of neural stem cells, ultimately ensuring the production of adequate numbers of neurons during corticogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».