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Enregistrement W4405796181 · doi:10.1136/rmdopen-2024-004628

Anatomy-centred deep learning improves generalisability and progression prediction in radiographic sacroiliitis detection

2024· article· en· W4405796181 sur OpenAlexaff
Felix J. Dorfner, Janis L. Vahldiek, Leonhard Donle, Andrei Zhukov, Lina Xu, Hartmut Häntze, Marcus R. Makowski, Hugo J.W.L. Aerts, Fabian Proft, Valeria Ríos Rodríguez, Judith Rademacher, Mikhail Protopopov, Hildrun Haibel, Kay‐Geert Hermann, Torsten Diekhoff, Lisa C Adams, Murat Torğutalp, Denis Poddubnyy, Keno K. Bressem

Notice bibliographique

RevueRMD Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpondyloarthritis Studies and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesJanssen BiotechBerlin Institute of HealthSwedish Orphan BiovitrumTechnische Universität MünchenEuropean CommissionBundesministerium für Bildung und ForschungCanon Medical Systems CorporationMax Kade FoundationSchering-PloughAbbVieBayern InnovativCelgenePfizerAustralian GovernmentWyethWilhelm Sander-StiftungAmgenEli Lilly and CompanyBristol-Myers Squibb
Mots-clésMedicineSacroiliitisDeep learningRadiographyRadiographic anatomyArtificial intelligenceAnatomyMedical physicsRadiologyDiseasePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To examine whether incorporating anatomy-centred deep learning can improve generalisability and enable prediction of disease progression. METHODS: This retrospective multicentre study included conventional pelvic radiographs of four different patient cohorts focusing on axial spondyloarthritis collected at university and community hospitals. The first cohort, which consisted of 1483 radiographs, was split into training (n=1261) and validation (n=222) sets. The other cohorts comprising 436, 340 and 163 patients, respectively, were used as independent test datasets. For the second cohort, follow-up data of 311 patients was used to examine progression prediction capabilities. Two neural networks were trained, one on images cropped to the bounding box of the sacroiliac joints (anatomy-centred) and the other one on full radiographs. The performance of the models was compared using the area under the receiver operating characteristic curve (AUC), accuracy, sensitivity and specificity. RESULTS: On the three test datasets, the standard model achieved AUC scores of 0.853, 0.817, 0.947, with an accuracy of 0.770, 0.724, 0.850. Whereas the anatomy-centred model achieved AUC scores of 0.899, 0.846, 0.957, with an accuracy of 0.821, 0.744, 0.906, respectively. The patients who were identified as high risk by the anatomy-centred model had an OR of 2.16 (95% CI 1.19, 3.86) for having progression of radiographic sacroiliitis within 2 years. CONCLUSION: Anatomy-centred deep learning can improve the generalisability of models in detecting radiographic sacroiliitis. The model is published as fully open source alongside this study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,560
Score d'incertitude au seuil0,392

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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