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Enregistrement W4405877673 · doi:10.1038/s41392-024-02076-9

Malate initiates a proton-sensing pathway essential for pH regulation of inflammation

2024· article· en· W4405877673 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueSignal Transduction and Targeted Therapy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeArmy Medical UniversityCentre Scientifique et Technique du BâtimentNational Institutes of HealthYork UniversitySouthwest HospitalFudan UniversitySchool of Pharmacy, Fudan UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaChongqing Medical UniversityWuhan UniversityNYU Langone Medical Center
Mots-clésCytosolBiochemistryMalate dehydrogenaseChemistrySignal transductionInflammationMetaboliteIn vitroDownregulation and upregulationCell biologyBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Metabolites can double as a signaling modality that initiates physiological adaptations. Metabolism, a chemical language encoding biological information, has been recognized as a powerful principle directing inflammatory responses. Cytosolic pH is a regulator of inflammatory response in macrophages. Here, we found that L-malate exerts anti-inflammatory effect via BiP-IRF2BP2 signaling, which is a sensor of cytosolic pH in macrophages. First, L-malate, a TCA intermediate upregulated in pro-inflammatory macrophages, was identified as a potent anti-inflammatory metabolite through initial screening. Subsequent screening with DARTS and MS led to the isolation of L-malate-BiP binding. Further screening through protein‒protein interaction microarrays identified a L-malate-restrained coupling of BiP with IRF2BP2, a known anti-inflammatory protein. Interestingly, pH reduction, which promotes carboxyl protonation of L-malate, facilitates L-malate and carboxylate analogues such as succinate to bind BiP, and disrupt BiP-IRF2BP2 interaction in a carboxyl-dependent manner. Both L-malate and acidification inhibit BiP-IRF2BP2 interaction, and protect IRF2BP2 from BiP-driven degradation in macrophages. Furthermore, both in vitro and in vivo, BiP-IRF2BP2 signal is required for effects of both L-malate and pH on inflammatory responses. These findings reveal a previously unrecognized, proton/carboxylate dual sensing pathway wherein pH and L-malate regulate inflammatory responses, indicating the role of certain carboxylate metabolites as adaptors in the proton biosensing by interactions between macromolecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle