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Enregistrement W4405895740 · doi:10.1002/ange.202420149

Phänomik‐basierte Entdeckung neuer orthosterischer Cholinkinase Inhibitoren

2024· article· de· W4405895740 sur OpenAlexaff
Ludwig G. Bauer, Jennifer Ward, Yvonne Sundström, Tuomas Tolvanen, Juan Carlos Alarcón Barrera, Sarantos Kostidis, Catherine Rogers, Ioanna Panagakou, Usha Singh, Elisabeth M. Rothweiler, Alejandro Gonzalez Orta, H. Ümit Kanıskan, Jianping Hu, Jian Jin, Sonja Sievers, Herbert Waldmann, Martin Giera, M. Sundström, Louise Berg, K. Huber

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie · 2024
Typearticle
Languede
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensDiscovery CentreStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilMinisterio de Ciencia, Tecnología e Innovación
Mots-clésChemistryPhenomicsDrug discoveryPharmacologyCombinatorial chemistryBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cholinkinase alpha (CHKA) ist ein zentraler Signalgeber innerhalb des Zellstoffwechsels, der mit Krebs und der Immunregulation in Verbindung gebracht wird. Die zelluläre und klinische Bewertung von CHKA als Zielstruktur für Wirkstoffe wurde bisher durch Herausforderungen bei der Entwicklung von arzneimittelähnlichen Cholinkinasehemmstoffen behindert. In der vorliegenden Studie zeigen wir mihilfe eines integrierten phänomischen Ansatzes, dass CHKA ein unerwartetes Off‐Target von Histonmethyltransferasehemmstoffen ist. Wir identifizieren CHKA als direkte Proteinzielstruktur der Aminochinazoline UNC0638 und UNC0737 durch eine Kombination von chemoproteomischen, biochemischen, zellulären und metabolischen Analysen. Diese Entdeckung erklärt möglicherweise die zuvor berichteten Diskrepanzen, die für unterschiedliche G9a/GLP‐Hemmstoffgerüste in zellulären Versuchen beobachtet wurden. Unter Verwendung von primären menschlichen Zellmodellsystemen weisen wir nach, dass die pharmakologische Beeinflussung von CHKA die IgG‐Freisetzung und die B‐Zell‐Reifung beeinträchtigt, im Einklang mit der These, dass der Cholin‐Stoffwechsel eine wichtige Rolle bei der Signalgebung des Immunsystems spielt. Die Kristallstrukturen von UNC0638 und UNC0737 im Komplex mit CHKA offenbaren einen unerwarteten Bindungsmodus und deuten darauf hin, dass diese Hemmstoffe als attraktive Ausgangspunkte für die Entwicklung selektiver chemischer Sonden zur weiteren Erforschung der biologischen Rolle von CHKA im Krebs‐ und Immunstoffwechsel genutzt werden können.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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