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Record W4405895740 · doi:10.1002/ange.202420149

Phänomik‐basierte Entdeckung neuer orthosterischer Cholinkinase Inhibitoren

2024· article· de· W4405895740 on OpenAlexaff
Ludwig G. Bauer, Jennifer Ward, Yvonne Sundström, Tuomas Tolvanen, Juan Carlos Alarcón Barrera, Sarantos Kostidis, Catherine Rogers, Ioanna Panagakou, Usha Singh, Elisabeth M. Rothweiler, Alejandro Gonzalez Orta, H. Ümit Kanıskan, Jianping Hu, Jian Jin, Sonja Sievers, Herbert Waldmann, Martin Giera, M. Sundström, Louise Berg, K. Huber

Bibliographic record

VenueAngewandte Chemie · 2024
Typearticle
Languagede
FieldComputer Science
TopicComputational Drug Discovery Methods
Canadian institutionsDiscovery CentreStructural Genomics Consortium
FundersH2020 European Research CouncilMinisterio de Ciencia, Tecnología e Innovación
KeywordsChemistryPhenomicsDrug discoveryPharmacologyCombinatorial chemistryBiochemistryMedicine

Abstract

fetched live from OpenAlex

Abstract Cholinkinase alpha (CHKA) ist ein zentraler Signalgeber innerhalb des Zellstoffwechsels, der mit Krebs und der Immunregulation in Verbindung gebracht wird. Die zelluläre und klinische Bewertung von CHKA als Zielstruktur für Wirkstoffe wurde bisher durch Herausforderungen bei der Entwicklung von arzneimittelähnlichen Cholinkinasehemmstoffen behindert. In der vorliegenden Studie zeigen wir mihilfe eines integrierten phänomischen Ansatzes, dass CHKA ein unerwartetes Off‐Target von Histonmethyltransferasehemmstoffen ist. Wir identifizieren CHKA als direkte Proteinzielstruktur der Aminochinazoline UNC0638 und UNC0737 durch eine Kombination von chemoproteomischen, biochemischen, zellulären und metabolischen Analysen. Diese Entdeckung erklärt möglicherweise die zuvor berichteten Diskrepanzen, die für unterschiedliche G9a/GLP‐Hemmstoffgerüste in zellulären Versuchen beobachtet wurden. Unter Verwendung von primären menschlichen Zellmodellsystemen weisen wir nach, dass die pharmakologische Beeinflussung von CHKA die IgG‐Freisetzung und die B‐Zell‐Reifung beeinträchtigt, im Einklang mit der These, dass der Cholin‐Stoffwechsel eine wichtige Rolle bei der Signalgebung des Immunsystems spielt. Die Kristallstrukturen von UNC0638 und UNC0737 im Komplex mit CHKA offenbaren einen unerwarteten Bindungsmodus und deuten darauf hin, dass diese Hemmstoffe als attraktive Ausgangspunkte für die Entwicklung selektiver chemischer Sonden zur weiteren Erforschung der biologischen Rolle von CHKA im Krebs‐ und Immunstoffwechsel genutzt werden können.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.003
Threshold uncertainty score0.011

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0010.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0030.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.028
GPT teacher head0.301
Teacher spread0.273 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2024
Admission routes1
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