MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4405945187 · doi:10.1128/mbio.02627-24

Delivery determinants of an <i>Acinetobacter baumannii</i> type VI secretion system bifunctional peptidoglycan hydrolase

2024· article· en· W4405945187 sur OpenAlexaff
Valeriya Bezkorovayna, Brooke K. Hayes, Francesca N. Gillett, Amy Wright, David I. Roper, Marina Harper, Sheena McGowan, John D. Boyce

Notice bibliographique

RevuemBio · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensImpact
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilDepartment of Health and Aged Care, Australian Government
Mots-clésPeptidoglycanEffectorAmidaseAcinetobacter baumanniiMicrobiologyType VI secretion systemBiologyLytic cycleBiochemistryBacteriaEnzymeGeneticsVirulencePseudomonas aeruginosa

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Acinetobacter baumannii is a Gram-negative opportunistic pathogen and is a common cause of nosocomial infections. The increasing development of antibiotic resistance in this organism is a global health concern. The A. baumannii clinical isolate AB307-0294 produces a type VI secretion system (T6SS) that delivers three antibacterial effector proteins that give this strain a competitive advantage against other bacteria in polymicrobial environments. Each effector, Tse15, Tde16, and Tae17, is delivered via a non-covalent interaction with a specific T6SS VgrG protein (VgrG15, VgrG16, and VgrG17, respectively). Here we define the regions of interaction between Tae17 and its cognate delivery protein VgrG17 and identify that amino acids G1069 and W1075 in VgrG17 are essential for Tae17 delivery via the T6SS, the first time such specific delivery determinants of T6SS cargo effectors have been defined. Furthermore, we determine that the Tae17 effector is a multidomain, bifunctional, peptidoglycan-degrading enzyme that has both amidase activity, which targets the sugar-peptide bonds, and lytic transglycosylase activity, which targets the peptidoglycan sugar backbone. Moreover, we show that the Tae17 transglycosylase activity is more important than amidase activity for the killing of Escherichia coli . This study provides molecular insight into how the T6SS allows A. baumannii strains to gain dominance in polymicrobial communities and thus improve their chances of survival and transmission. IMPORTANCE We have shown that the Acinetobacter baumannii T6SS effector Tae17 is a modular, bifunctional, peptidoglycan-degrading enzyme that has both lytic transglycosylase and amidase activities. Both activities contribute to the ability to degrade peptidoglycan, but the transglycosylase activity was more important for the killing of Escherichia coli . We have defined the specific regions of Tae17 and its cognate delivery protein VgrG17 that are necessary for the non-covalent interactions and, for the first time, identified specific amino acids essential for T6SS cargo effector delivery. This work contributes to our molecular understanding of bacterial competition strategies in polymicrobial environments and may provide a window to design new therapeutic approaches for combating infection by A. baumannii .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemBioMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207