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Enregistrement W4405986701 · doi:10.1038/s41467-024-55597-w

Single-cell RNA sequencing identifies CXADR as a fate determinant of the placental exchange surface

2025· article· en· W4405986701 sur OpenAlexafffund
Dafina M. Angelova, Aleksandra O Tsolova, Malwina Prater, Noura Ballasy, Wendi Bacon, Russell S. Hamilton, Danielle Blackwell, Ziyi Yu, Xin Li, Xin Liu, Myriam Hemberger, D. Stephen Charnock‐Jones

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Children's Hospital Research InstituteDirectorate for Biological SciencesResearch Councils UKCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute for Health and Care ResearchCanada Research ChairsBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDepartment of Health and Social CareGovernment of Canada
Mots-clésLineage (genetic)TrophoblastBiologySyncytiotrophoblastPlacentaCell biologyStem cellProgenitor cellCellular differentiationCellRNACell lineageGeneticsGeneFetusPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The placenta is the critical interface between mother and fetus, and consequently, placental dysfunction underlies many pregnancy complications. Placental formation requires an adequate expansion of trophoblast stem and progenitor cells followed by finely tuned lineage specification events. Here, using single-cell RNA sequencing of mouse trophoblast stem cells during the earliest phases of differentiation, we identify gatekeepers of the stem cell state, notably Nicol1, and uncover unsuspected trajectories of cell lineage diversification as well as regulators of lineage entry points. We show that junctional zone precursors and precursors of one of the two syncytial layers of the mouse placental labyrinth, the Syncytiotrophoblast-I lineage, initially share similar trajectories. Importantly, our functional analysis of one such lineage precursor marker, CXADR, demonstrates that this cell surface protein regulates the differentiation dynamics between the two syncytial layers of the mouse labyrinth, ensuring the correct establishment of the placental exchange surface. Deciphering the mechanisms underlying trophoblast lineage specification will inform our understanding of human pregnancy in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil0,381

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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