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Enregistrement W4405991266 · doi:10.31742/isgpb.84.3.18

Pathogenic and genetic variation among Fusarium graminearum isolates causing head scab of wheat in India

2024· article· en· W4405991266 sur OpenAlexaboutno aff
Akshay Kumar H M, Rashmi Aggarwal, Malkhan Singh Gurjar, Himanshu Dubey, P. Nallathambi, M. S. Saharan

Notice bibliographique

RevueIndian Journal of Genetics and Plant Breeding (The) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusariumBiologyGenetic variationVeterinary medicineBotanyGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) or head scab of wheat caused by Fusarium spp., is a global concern as recent outbreaks reported in Canada, Europe, Asia, Australia and South America. Presently, FHB is a minor disease in India but can cause significant yield loss if rain occurs during mid anthesis in Himachal Pradesh, Uttarakhand, the foot hills of Punjab and hilly areas in Tamil Nadu. Among head scab infected wheat ear heads collected from Dalang Maidan, Lahaul valley of Himachal Pradesh and Wellington, Nilgiris hills, Tamil Nadu, dominance of F. graminearum was observed. Twenty-nine Fusarium isolates were identified as F. graminearum based on morphological, cultural and molecular approaches. Pathogenic variation among 29 F. graminearum isolates was observed on wheat varieties (UP 2338, PBW 343, Sonalika, HD 2967, HD 3086, HD 29, MACS 5049, HS 645, VL 1013). After 7 and 14 days of inoculation, isolates from Wellington (Fg-W10 and Fg-W24) were found highly pathogenic while isolates Fg-W7 and Fg-W26 were found least pathogenic. Out of 23 SSR markers designed using whole genome sequence of F. graminearum PH-1 strain, 21 SSRs amplified F. graminearum isolates. Cluster analysis separated the isolates into two main groups. Group A consisting two isolates one from Wellington (Fg-W27) and another from Lahaul Spiti (Fg-L2). Group B contained all other 27 isolates. This study has shown that there is considerable pathogenic and genetic variability among F. graminearum isolates obtained from infected wheat ear heads from different geographic regions of India.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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