Pilot for Harmonization of Diagnostic Protocols for Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV) in Tomato and Pepper Seeds
Notice bibliographique
Résumé
Global seed trade is subject to various national, regional, and international regulations to prevent the introduction and spread of harmful seed-borne and seed-transmitted pathogens. When the plant health regulatory agencies of trading partners employ different diagnostic protocols for the same pathogen, contradictory test results may require additional testing that can cause delays in trade. Establishing equivalency of diagnostic protocols may expedite trade by adding confidence to diagnostic test results. The member countries of the North American Plant Protection Organization (NAPPO) conducted a project evaluating several diagnostic protocols for a seed-transmitted virus, tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV), an emerging pathogen that has severely affected tomato and pepper fruit and seed production and trade globally. The objective of the study was to find protocols that could be harmonized among NAPPO member countries, thereby avoiding retesting of samples at different border points. The project was a collaboration between academia, industry, trade organizations, and national plant protection organizations (NPPOs). Three end-point PCR and two real-time PCR protocols were evaluated via a ring test. Nine laboratories from Canada, the United States, and Mexico participated in the ring test, which generated 3,680 data points from analytical, diagnostic, and calibrator samples. Four out of five diagnostic protocols were found to be fully transferable, and three protocols demonstrated optimal performance for accurate, reproducible, and user-friendly detection. The results of this regional effort will simplify the detection of ToBRFV-infected seeds in NAPPO member countries and demonstrate a way to establish equivalency of testing methods between the NPPOs. [Formula: see text] Copyright © 2025 The Author(s). This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».