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Enregistrement W4406056338 · doi:10.1371/journal.pone.0316727

PtpA protein from Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis as a potential marker of rheumatoid arthritis in humans

2025· article· en· W4406056338 sur OpenAlexaff
Jorge Hernández‐Bello, Horacio Bach, Sergio Cerpa‐Cruz, Gabriela Athziri Sánchez‐Zuno, Rodolfo Hernández‐Gutiérrez, Ferdinando Nicoletti, Andrea Saraceno, José Francisco Muñóz-Valle

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversidad de Guadalajara
Mots-clésMycobacterium avium subspecies paratuberculosisParatuberculosisImmunologyRheumatoid arthritisImmune systemAntibodyBiologyMedicineMycobacteriumPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies have noted the connection between Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) and autoimmunity. MAP is an intracellular pathogen that infects and multiplies in macrophages. To overcome the hostile environment elicited by the macrophage, MAP secretes a battery of virulence factors to neutralize the toxic effects of the macrophage. One of the virulence factors is the Protein Tyrosine Phosphatase A (PtpA), a protein secreted by MAP that interferes in the phago-lysosome fusion, rendering the pathogen unnoticed in the cytoplasm of the macrophage. This study aimed to assess the presence of PtpA antibodies in the sera of Mexican individuals with rheumatoid arthritis (RA) and investigate its possible use as a biomarker for disease activity. We compared RA patients (n = 100) to control subjects (CS) (n = 100) by assessing specific immune responses to PtpA (the antigen) by an indirect ELISA method. Results showed a significant difference in PtpA levels between RA and CS, with RA patients having a median OD of 0.4645 compared to 0.1372 in CS. Antibodies against PtpA were present in 95% of RA patients and 16% of CS (AUC = 0.9163, p = 0.0001). Male control subjects showed higher PtpA reactivity than female CS. The Disease Activity Score (DAS-28) analysis showed that individuals with moderate to high disease activity had lower levels of PtpA reactivity. The results suggest a potential connection between RA and MAP infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
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Résumé présentoui

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