Transcriptional dynamics during karyogamy in rice zygotes
Notice bibliographique
Résumé
Upon fertilization, male and female nuclei fuse to form the zygotic nucleus in angiosperms. Karyogamy is considered to be essential for proper embryogenesis; however, the transcriptional dynamics during karyogamy in plant zygotes remain unclear. In this study, we performed a single-cell transcriptome analysis of rice zygotes at six early developmental stages (15 min, 30 min, 1 h, 2 h, 4 h, and 6 h after gamete fusion) to reveal gene expression profiles during karyogamy in plant zygotes. The time-series RNA-sequencing analysis detected possible de novo and altered gene expression in zygotes from 15 min post-fertilization. Fertilization-induced transcription during karyogamy was characterized by protein interaction database and gene ontology (GO) analyses. Furthermore, paternal allele transcription was initiated approximately 30 min to 1 h after gamete fusion, when nuclear fusion begins in the zygote. Some transcripts preferentially expressed in egg cells were downregulated after gamete fusion. Moreover, a dynamic shift from maternal-biased transcripts to bi-parental expression occurred during early zygotic development. These results suggest that transcriptional dynamics during karyogamy plays an initial role in proper and sequential zygotic development and embryogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».