Transcriptomic and Functional Landscape of Adult Human Spinal Cord NSPCs Compared to iPSC-Derived Neural Progenitor Cells
Notice bibliographique
Résumé
The adult human spinal cord harbors diverse populations of neural stem/progenitor cells (NSPCs) essential for neuroregeneration and central nervous system repair. While induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived NSPCs offer significant therapeutic potential, understanding their molecular and functional alignment with bona fide spinal cord NSPCs is crucial for developing autologous cell therapies that enhance spinal cord regeneration and minimize immune rejection. In this study, we present the first direct transcriptomic and functional comparison of syngeneic adult human NSPC populations, including bona fide spinal cord NSPCs and iPSC-derived NSPCs regionalized to the spinal cord (iPSC-SC) and forebrain (iPSC-Br). RNA sequencing analysis revealed distinct transcriptomic profiles and functional disparities among NSPC types. iPSC-Br NSPCs exhibited a close resemblance to bona fide spinal cord NSPCs, characterized by enriched expression of neurogenesis, axon guidance, synaptic signaling, and voltage-gated calcium channel activity pathways. Conversely, iPSC-SC NSPCs displayed significant heterogeneity, suboptimal regional specification, and elevated expression of neural crest and immune response-associated genes. Functional assays corroborated the transcriptomic findings, demonstrating superior neurogenic potential in iPSC-Br NSPCs. Additionally, we assessed donor-specific influences on NSPC behavior by analyzing gene expression and differentiation outcomes across syngeneic populations from multiple individuals. Donor-specific factors significantly modulated transcriptomic profiles, with notable variability in the alignment of iPSC-derived NSPCs to bona fide spinal cord NSPCs. Enrichment of pathways related to neurogenesis, axon guidance, and synaptic signaling varied across donors, highlighting the impact of genetic and epigenetic individuality on NSPC behavior.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».