Toxigenecity and Virulence variations of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> from out-patients hospitals in Southwest Nigeria
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Background Multidrug resistant (MDR) Pseudomonas aeruginosa isolates harboring genes for virulence and antibiotic resistance, have grown more prevalent lately. These strains pose a major threat to the general population, especially in tertiary care settings. There is a paucity of information on toxigenic and virulence diversity of multidrug resistant P. aeruginosa in Nigeria, hence, the need to characterize and determine the variations of the virulence genes. Methods Six hundred clinical samples from different anatomical sites were collected aseptically from Lagos University Teaching Hospital (LUTH), University of Medical Sciences, Ondo (UNIMED) and Federal Medical Centre, Abeokuta (FMC). Pseudomonas aeruginosa was isolated using cetrimide agar identified using biochemical tests. Antibiotic sensitivity was done by disc diffusion method. Protease, phospholipase C (lecithinase), caseinase and gelatinase presence were assayed for. Genomic DNA was extracted from P. aeruginosa isolates and screened for the presence of N-Acetylneuraminate synthase (NaN), Elastase B ( Las B), Exotoxin A (ExoA), Exoenzyme S (ExoS) and Exoenzyme U (ExoU) virulence genes by PCR. Results Three hundred and sixty bacterial isolates identified from clinical samples are as follows: Pseudomonas aeruginosa (11.3%), Escherichia coli (18.0%), Klebsiella pneumoniae (14.3%), Staphylococcus aureus (10.2%), Proteus mirabilis (3.2%), Streptococcus pnuemoniae (2.3% ), Enterobacter aerogenes (0.5%) and Acinetobacter baumanni (0.1%). Enzymes detected in the P. aeruginosa isolates were Phospholipase C (77.9%), caseinase (83.9%), gelatinase (98.5%) and protease (88.2%). The P. aeruginosa isolates were all resistant to ampicillin and cloxacillin; 26 (38.2 %) strains exhibited multidrug resistance. Virulence Las B elastase gene was detected in all 14 multi resistant P. aeruginosa , ExoA was detected in 5, ExoS in 4, ExoU in 5 and NaN in 4 isolates: Four (28.6%) Conclusion The study confirmed presence and variations of toxic genes in Pseudomonas aeruginosa isolated from all the three tertiary hospitals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».