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Enregistrement W4406187403 · doi:10.1163/22941932-bja10176

Zooming into refractory timber: enhancing anatomical identification with confocal laser scanning microscopy and fluorescence

2025· article· en· W4406187403 sur OpenAlexafffund
Martine Blais, Philippe Tanguay, Isabelle Duchesne, Danny Rioux

Notice bibliographique

RevueIAWA Journal - KU Leuven/IAWA Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueWood and Agarwood Research
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaEnvironment and Climate Change CanadaUniversité Laval
Mots-clésAutofluorescenceParenchymaOptical sectioningConfocal laser scanning microscopyMicroscopyLight sheet fluorescence microscopyFluorescence microscopeIdentification (biology)Confocal microscopyConfocalMaterials scienceFluorescenceBiomedical engineeringPathologyBiologyBiophysicsOpticsBotanyMedicineCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Accurate wood identification is crucial for combatting the illegal logging and trade of forest products worldwide. However, certain challenges such as small specimen size, high wood density, and level of degradation can complicate the identification process. There is therefore a need to develop methods and use complementary techniques in forensic wood identification, particularly for difficult samples. This study utilized confocal laser scanning microscopy (CLSM) to detect and locate autofluorescence of axial parenchyma cells (APCs) to facilitate the identification of three challenging unknown wood specimens. These specimens posed difficulties for sectioning with a microtome due to brittleness, density, or small size constraints. CLSM results were compared with those from conventional light compound and stereomicroscopy. In our investigation, the three unknown wood samples were identified as Bobgunnia cf. fistuloides, Chlorocardium cf. rodiei, and Diphysa cf. carthagenensis. Specifically, CLSM confirmed the absence of apotracheal parenchyma in B. cf. fistuloides, which could not be determined using fluorescence stereomicroscopy. For D. cf. carthagenensis, CLSM’s fluorescence intensity highlighted axial parenchyma effectively, surpassing fluorescence stereomicroscopy. A notable advantage of our non-invasive CLSM method was its ability to examine smooth, unsectioned block surfaces, thereby enhancing preservation and ‘in-situ’ visualization of APCs. Our results combining autofluorescence and CLSM clearly offered superior resolution in observing APCs compared to traditional microscopy and can thus be applied for increasing confidence in wood species identification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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