Subtle genomic differences in Klebsiella pneumoniae sensu stricto isolates indicate host adaptation
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Notice bibliographique
Résumé
Klebsiella pneumoniae sensu stricto (Kpl) is an opportunistic pathogen capable of residing as a commensal in both human and bovine intestinal tracts and can cause serious systemic infections in humans and severe clinical mastitis in dairy cattle. It is unclear what role zoonotic and anthroponotic transmission play in the dissemination of Kpl. In this study, we use a comparative genomic approach to identify differences between Kpl associated with disease in humans and cattle and aimed to identify any potential genetic barriers limiting transmission of Kpl between these two hosts. A total of 128 Kpl strains (bovine n = 65; human n = 63) were whole genome sequenced and human and bovine strains were compared based on phylogenomics, the pangenome, mobile genetic elements, and differential gene abundance. No obvious phylogenomic differentiation was observed between isolates from these hosts. However, subtle genetic differences exist between bovine and human KpI which likely reflect environmental adaptation to different host niches, including a higher representation of gene clusters encoding ferric citrate uptake transporters, as well as histidine, arginine, and lactose utilization pathways in bovine isolates. These gene clusters may be positively selected due to the unique metabolic environment of the mammary gland, where lactose, citrate-bound iron, and amino acids like histidine and arginine provide growth advantages for KpI during mastitis. Overall, our study identified no obvious genetic barriers to zoonotic transmission of Kpl within the dairy environment and provides insight into the development of host-specific therapeutic options for KpI infections in humans and bovine. • Klebsiella pneumoniae sensu stricto (KpI) causes infections in dairy cattle and humans. • A comparative genomics approach identified differences in the genomes of KpI isolated from bovine or human hosts. • Subtle genetic differences in bovine and human KpI isolates likely reflect environmental adaptations. • Bovine KpI have more gene clusters for ferric citrate, lactose, histidine, and arginine metabolism. • No obvious genetic barriers to KpI zoonotic transmission in dairy environments were identified.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
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| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
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