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Enregistrement W4406347044 · doi:10.20944/preprints202501.0862.v1

From Birds to Bovine: A Review and Critical Analysis of the Outbreaks of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) Clade 2.3.4.4b in the United States

2025· review· en· W4406347044 sur OpenAlexaboutno aff
Mohammad Jawad Jahid, Jacqueline M. Nolting

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInfluenza A virus subtype H5N1OutbreakBiologyCladeVirusTransmission (telecommunications)VirologyPopulationHighly pathogenicInfluenza A virusVeterinary medicinePhylogenetic treeGeneticsEnvironmental healthGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In late 2021, Eurasian-lineage highly pathogenic avian influenza (HPAI) A(H5N1) viruses from HA clade 2.3.4.4b were first detected in the United States, marking a significant milestone in their global spread. . These viruses have caused severe morbidity and mortality in poultry and have been found in various wild birds, mammals, and even dairy herds, leading to decreased milk productiondetected in numerous wild and domestic animals, including cows and humans. Notably, Infected infected cows transmitted the virus to cats, causing neurological symptomsextreme pathogenicity and death and recently, a pig cohabiting with poultry tested positive. While human-to-human spread of the virus has not been recorded, efficient transmission of the bovine-origin virus has also led to extreme pathogenicity and death in ferrets’ models. Recently, markers in PB2 (E627K) and HA (E186D, Q222H), indicating mammalian adaptation mutations, were detected in a patient manifesting critical illness in Canada. These, combined by instances of interspecies spread of the virus, Though the virus poses minimal risk to the general population, as no mammalian adaptation mutations or evidence of human-to-human transmission have been detected, instances of interspecies transmission have raised global public health concerns. These include cases where the virus spread from poultry and cows to humans, with respiratory transmission observed in bovine-origin viruses. This could highlights the potential for the virus to successfully adapt to mammals, posing a serious risk of a global outbreak. A One Health approach is, thereby, necessary to monitor and control the outbreak. This review aims to analyze the epidemiology, transmission, and ecological impacts of HPAI A(H5N1) clade 2.3.4.4b in the U.S., identify knowledge gaps, and inform strategies for effective outbreak management and mitigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,208
Tête enseignante GPT0,485
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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