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Enregistrement W4406354311 · doi:10.1186/s13195-024-01661-y

Exome sequencing reveals a rare damaging variant in GRIN2C in familial late-onset Alzheimer's disease

2025· article· en· W4406354311 sur OpenAlexafffund
Elisa Rubino, Maria Italia, Elisa Di Giorgio, Silvia Boschi, Paola Dimartino, Tommaso Pippucci, Fausto Roveta, Clara Cambria, Gabriella Elia, Andrea Marcinnò, Salvatore Gallone, Ekaterina Rogaeva, Flavia Antonucci, Alfredo Brusco, Fabrizio Gardoni, Innocenzo Rainero

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s Research & Therapy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDipartimenti di EccellenzaUniversità degli Studi di TorinoConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementAssociazione Italiana Ricerca AlzheimerFondazione CRT
Mots-clésPSEN1Exome sequencingMissense mutationGeneticsBiologyExomeEarly-onset Alzheimer's diseaseAlzheimer's diseaseMutationGeneMedicineDiseasePresenilinInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Alzheimer's disease (AD) is a progressive neurodegenerative disorder with both genetic and environmental factors contributing to its pathogenesis. While early-onset AD has well-established genetic determinants, the genetic basis for late-onset AD remains less clear. This study investigates a large Italian family with late-onset autosomal dominant AD, identifying a novel rare missense variant in GRIN2C gene associated with the disease, and evaluates the functional impact of this variant. Methods Affected and unaffected members from a Northern Italian family were included. Genomic DNA from family members was extracted and initially screened for pathogenic mutations in APP, PSEN1, and PSEN2, and screened for 77 genes associated with neurodegenerative conditions using NeuroX array assay. Exome sequencing was performed on three affected individuals and two healthy relatives. Bioinformatics analyses were conducted. Functional analysis was performed using primary neuronal cultures, and the impact of the variant was assessed through immunocytochemistry and electrophysiology. Results Pathogenic variants were not identified in APP, PSEN1, or PSEN2, nor in the 77 genes in NeuroX array assay. Exome Sequencing revealed the c.3215C > T p.(A1072V) variant in GRIN2C gene (NM 000835.6), encoding for the glutamate ionotropic receptor N-methyl-D-aspartate receptor (NMDA) type subunit 2C (GluN2C). This variant segregated in 6 available AD patients in the family and was absent in 9 healthy relatives. Primary rat hippocampal neurons overexpressing GluN2CA1072V showed an increase in NMDAR-induced currents, suggesting altered glutamatergic transmission. Surface expression assays demonstrated an elevated surface/total ratio of the mutant GluN2C, correlating with the increased NMDAR current. Additionally, immunocytochemistry revealed in neurons expressing the mutant variant a reduced colocalization between the GluN2C subunit and 14-3-3 proteins, which are known to facilitate membrane trafficking of NMDARs. Discussion We identified a rare missense variant in GRIN2C associated with late-onset autosomal dominant Alzheimer's disease. These findings highlight the role of GluN2C-containing NMDARs in glutamatergic signaling and their potential contribution to AD pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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