The small GTPase MRAS is a broken switch
Notice bibliographique
Résumé
Intense research on founding members of the RAS superfamily has defined our understanding of these critical signalling proteins, leading to the premise that small GTPases function as molecular switches dependent on differential nucleotide loading. The closest homologs of H/K/NRAS are the three-member RRAS family, and interest in the MRAS GTPase as a regulator of MAPK activity has recently intensified. We show here that MRAS does not function as a classical switch and is unable to exchange GDP-to-GTP in solution or when tethered to a lipid bilayer. The exchange defect is unaffected by inclusion of the GEF SOS1 and is conserved in a distal ortholog from nematodes. Synthetic activating mutations widely used to study the function of MRAS in a presumed GTP-loaded state do not increase exchange, but instead drive effector binding due to sampling of an activated conformation in the GDP-loaded state. This includes nucleation of the SHOC2-PP1Cα holophosphatase complex. Acquisition of NMR spectra from isotopically labeled MRAS in live cells validated the GTPase remains fully GDP-loaded, even a supposed activated mutant. These data show that RAS GTPases, including those most similar to KRAS, have disparate biochemical activities and challenge current dogma on MRAS, suggesting previous data may need reinterpretation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».