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Enregistrement W4406424764 · doi:10.26434/chemrxiv-2024-l40ch-v2

Compositional and functional diversity of minimal primitive coacervates in a nucleic acid-peptide world

2025· preprint· en· W4406424764 sur OpenAlexafffund
Karina K. Nakashima, Fatma Zohra Mihoubi, Jagandeep S. Saraya, Kieran Russell, Fidan Rahmatova, James D. Robinson, Maria Julia Maristany, Jan Huertas, Roger Rubio‐Sánchez, Rosana Collepardo‐Guevara, Derek K. O’Flaherty, Claudia Bonfio

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle metabolism and nutrition
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesChina Scholarship CouncilGovernment of the United KingdomUniversité de StrasbourgAgence Nationale de la RechercheHORIZON EUROPE Framework ProgrammeNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInternational Business Machines CorporationEuropean CommissionEngineering and Physical Sciences Research CouncilUK Research and Innovation
Mots-clésNucleic acidCoacervateDiversity (politics)Functional diversityPeptide nucleic acidPeptideChemistryComputational biologyCombinatorial chemistryBiochemistryBiologyEcologyPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The RNA-peptide world hypothesis postulates the early co-evolution of RNA and peptides, leading to the emergence of non-enzymatic RNA replication and peptide synthesis. Although nucleotides and amino acids were shown to form and polymerise under prebiotic conditions, the origin of their synergy, ubiquitously preserved in the central dogma of modern biology, remains unclear. We propose that the cooperation between DNA, RNA and peptides might have stemmed from their co-localisation in early compartments. Here we show that heterogeneous mixtures of prebiotic oligonucleotides and peptides spontaneously assemble into primitive coacervates. Experimental and computational studies reveal that peptide/nucleic acid coacervates are more robust and form over a broader range of conditions than peptide/peptide analogues. Notably, RNA-based coacervates exhibit exceptional stability and, in the presence of DNA, minimal viscosity, facilitating the diffusion of reactive oligonucleotides and supporting prebiotic RNA chemistry. Our findings suggest that coacervation may have occurred in the early on the evolutionary timeline, fostering the emergence of a nucleic acid-peptide world. This study provides new insights into the prebiotic role of coacervates, reconsidering their significance in the origins of life and the emergence of primitive replication and translation systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,435
Score d'incertitude au seuil0,751

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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