HSP10 and HSP20 involved in the adaptation of Eriocheir sinensis under air exposure stress
Notice bibliographique
Résumé
Air exposure stress is one of the most common challenges faced by aquatic animals. Eriocheir sinensis , as a migratory crustacean that inhabits a variety of environments, is an excellent model for studying air exposure adaptation in aquatic animals. Small heat shock proteins (sHSPs), HSP10 and HSP20, as highly conserved molecular chaperones, are often involved in various stresses. Therefore, we aim to explore the functional information of sHSPs in stress resistance and evolution in the E. sinensis . In this study, through the E. sinensis genome, five HSP10 and fourteen HSP20 sequences were identified. HSP20 sequences showed differently duplicated models including tandem duplications and proximal duplications. Four HSP10 and one HSP20 were not expressed in all transcriptome data and were identified as pseudogenes . It was thought that the production of these pseudogenes was caused by the absence of key motifs. Except for these pseudogenes, all genes were responsive to air exposure stress in hepatopancreas, indicating that HSP10 and HSP20 were involved in the response of E. sinensis to air exposure stress. RNA interference assay revealed that HSP20 response to air exposure stress were regulated by hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α). The count difference of exon and intron in HSP20 could influence whether HSP20 was expressed in the gills or not under stress. Tandem duplications located on different chromosomes had differences in gene expression, which may result from selective pressure. These results should deepen our understanding of the stress resistance functions of sHSPs and offer new insights into the environmental adaptation of E. sinensis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».