DOP133 Spatiotemporal analysis of Crohn’s disease reveals PECAM2 signaling at the basis of inflammation-to-fibrosis transition
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Crohn’s disease is a chronic inflammatory disease of the bowel often complicated by fibrotic strictures(1,2,3). Medical treatment is lacking, and surgery is commonly required(3). The mechanisms underlying the progression from chronic inflammation to fibrosis are not yet defined. We aim to unravel Crohn’s disease pathogenesis using cutting-edge computational and bioinformatics tools (Figure 1). Methods Spatial transcriptomics was performed on 13 surgical specimens of inflamed and fibrotic Crohn’s disease and healthy controls. Spatial transcriptomics results were integrated with single-cell data to track the cellular and molecular evolution from healthy intestine to fibrosis by employing CellChat(4) and pseudotime analysis. Computational data were confirmed by immunostaining of tissues from an independent cohort of Crohn’s patients. Results We demonstrated that intestinal cytoarchitecture was rearranged while chronic inflammation progressed. Crohn’s disease-associated fibrosis evolved within the mesenchymal compartment, driven by PECAM2 signaling through PECAM1-CD38 interaction. Notably, CD38 positivity was found in the mesenchymal compartment in an independent cohort of Crohn’s disease patients. In parallel, ApoA signaling, particularly APOA1-ABCA interaction, emerged as relevant for maintaining epithelial and stromal homeostasis, while its downregulation was associated with fibrosis development (Figure 2). Conclusion Our results provide insights into CD38-driven fibrosis and suggest that PECAM2 signaling blockade could reduce the development of strictures in patients with Crohn’s disease, potentially offering a new treatment target. References 1.Torres J, Mehandru S, Colombel J-F, et al. Crohn’s disease. Lancet 2017;389:1741–1755. 2.Lichtenstein GR, Loftus EV, Isaacs KL, et al. ACG clinical guideline: management of crohn’s disease in adults. Am. J. Gastroenterol. 2018;113:481–517. 3.Rieder F, Kessler S, Sans M, et al. Animal models of intestinal fibrosis: new tools for the understanding of pathogenesis and therapy of human disease. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 2012;303:G786-801. 4.Jin S, Plikus MV, Nie Q. CellChat for systematic analysis of cell-cell communication from single-cell and spatially resolved transcriptomics. BioRxiv 2023.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».