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Enregistrement W4406736918 · doi:10.1128/jb.00388-24

The GacS/GacA two-component system strongly regulates antimicrobial competition mechanisms of <i>Pseudomonas fluorescens</i> MFE01 strain

2025· article· en· W4406736918 sur OpenAlexaff
Charly Dupont, Yvann Bourigault, Héloise Bizière-Maco, Amine M. Boukerb, Xavier Latour, Corinne Barbey, Julien Verdon, Annabelle Mérieau

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas fluorescensBiologyMutantTransposon mutagenesisGeneType VI secretion systemGeneticsTranscriptomeTransposable elementMicrobiologyWild typeGene expressionBacteriaVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Pseudomonas fluorescens MFE01 is an environmental bacterium characterized by an hyperactive type 6 secretion system (T6SS) and a strong emission of volatile organic compounds (VOCs). In a previous study, a transposition mutant, 3H5, exhibited an inactive T6SS and altered VOC emission. In 3H5, the interruption of trpE gene by the transposon was insufficient to explain these phenotypes. To determine the actual impact of this insertion, a comparative transcriptomic analysis was performed on the two-component system GacS/GacA, known to influence numerous phenotypes in Pseudomonas . The results demonstrated that the gacS gene is less expressed in 3H5 than in MFE01. Phenotypic analysis of a gacS deletion mutant, Δ gacS , confirmed many similarities between Δ gacS and 3H5. Indeed, Δ gacS exhibited an inactive T6SS and an altered VOC emission profile. In-depth analysis of volatilomes and phenotypes correlated with the decrease in gacS transcription, highlighting that the emission of 1-undecene is under the strict control of GacS/GacA. This study confirms that 1-undecene is not the sole volatile molecule responsible for MFE01’s inhibition of Legionella . Moreover, MFE01 has antimicrobial activity against the phytopathogenic oomycetes Phytophthora infestans via hydrogen cyanide (HCN) emission, which is also controlled by GacS. In MFE01, GacS/GacA is also a partial positive regulator of other VOC emission, whose reduced emission in 3H5 coincides with the decrease in gacS transcription. IMPORTANCE Our model strain Pseudomonas fluorescens MFE01 uses an active type VI secretion system (T6SS) and volatile compounds (VCs) to outcompete other microorganisms in the natural environment. By investigating the cellular mechanism regulating the production of these weapons, we identified the two-component system GacS/GacA. Indeed, GacS cellular membrane sensor plays a crucial role in regulating T6SS activity and VC emission. Among the latter, 1-undecene and hydrogen cyanide are strong aerial inhibitors of the Legionella human pathogen and the Phytophtora infestans major plant pest, respectively. The aim is to improve the understanding of the regulation of these volatile molecule emission and the critical role of a global regulator in both plant and human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,555

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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