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Enregistrement W4406824741 · doi:10.1101/2025.01.24.634803

Synaptome architecture shapes regional dynamics in the mouse brain

2025· preprint· en· W4406824741 sur OpenAlexafffund
Justine Y. Hansen, Andrea I. Luppi, Zhen Qiu, Silvia Gini, Ben Fulcher, Seth G. N. Grant, Bratislav Mišić

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlanarian Biology and Electrostimulation
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsFondation Brain Canada
Mots-clésDynamics (music)ArchitectureNeuroscienceComputer scienceBiologyGeographyPsychologyArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Synapses are the connections that transform neurons from simple electrically charged cells into complex circuits that support perception, cognition and action. Recent advances in single-punctum synapse mapping in mice have made it possible to study the diversity of synapses and how these synapse types are differentially expressed across the brain. A salient question is how synapse diversity shapes the spatial patterning of whole-brain dynamics. Here we derive > 6 000 time-series features from fMRI recordings in awake mice to construct a comprehensive macroscale dynamical phenotype of each synapse type. We find that spatial variation in synapse types colocalizes with spatial variation in regional dynamics. Time-series in regions enriched for SAP102-expressing synapses display high-amplitude events while time-series in regions enriched for PSD95-expressing synapses display low stationarity. These regional variations in synapse types and dynamics are associated with patterns of structural and functional connectivity and the placement of hubs. Finally, using two additional fMRI datasets in anaesthetized mice, we show that synapses expressing short- and long-lifetime proteins are differentially engaged across behavioural states. Collectively, this work demonstrates that the spatial organization of microscale synapse types fundamentally shapes whole-brain dynamics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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