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Enregistrement W4407103282 · doi:10.1101/2025.01.31.635880

Multiple fertility restorer loci for cytoplasmic male sterility caused by <i>orf137</i> in tomato

2025· preprint· en· W4407103282 sur OpenAlexfundno aff
Yurie Iki, Issei Harada, Kentaro Ezura, Seira Mashita, Kosuke Kuwabara, Hitomi Takei, Atsushi Toyoda, Kenta Shirasawa, Tohru Ariizumi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBio-oriented Technology Research Advancement InstitutionJapan Society for the Promotion of ScienceInstitute of GeneticsUniversity of Tsukuba
Mots-clésSterilityFertilityCytoplasmic male sterilityBiologyMale fertilityGeneticsAndrologyMedicineDemographySociologyPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cytoplasmic male sterility (CMS) in plants is caused by incompatibility between nuclear and cytoplasmic genetic information. Fertility can be restored through the action of fertility restoration ( RF ) genes, which are usually present in the nucleus. CMS lines of tomato ( Solanum lycopersicum ) have been developed from asymmetric cell fusions, in these lines, cultivated tomato served as a nuclear donor and its wild relative, S. acaule , as a cytoplasm donor. Although RF genes are present in wild relatives of tomato, no genetic or genomic information on the RF genes is yet available. This study reports an RF genetic locus, RF1 , on chromosome 1 of S. pimpinellifolium LA1670 and S. lycopersicum var. cerasiforme LA1673 that was revealed by bulked segregant analysis and sequencing. An additional RF locus, RF2 , was identified on chromosome 2 of LA1670. A transgenic approach identified two other candidate genes that also restored fertility. The genomic sequence of S. cheesmaniae LA0166 was assembled using high-fidelity, long-read sequencing technology. Sequence comparisons identified further candidate RF genes on chromosome 1 of S. cheesmaniae LA0166. These results suggested that multiple gene loci control the fertility restoration trait in wild relatives of tomato.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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